165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0484 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0484  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  100 
 
 
256 aa  520  1e-147  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2926  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator, putative  79.28 
 
 
253 aa  419  1e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0544  CoA enzyme activase  78.35 
 
 
263 aa  413  1e-114  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0392  CoA-substrate-specific enzyme activase  74.1 
 
 
256 aa  385  1e-106  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0386  CoA-substrate-specific enzyme activase  73.71 
 
 
256 aa  382  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2727  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator, putative  59.92 
 
 
260 aa  311  5.999999999999999e-84  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2687  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  51.79 
 
 
251 aa  271  1e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00343965  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3624  CoA-substrate-specific enzyme activase  51.29 
 
 
275 aa  270  1e-71  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000071885  normal  0.336364 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4398  CoA-substrate-specific enzyme activase  50.76 
 
 
266 aa  265  5.999999999999999e-70  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000662171  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3104  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  50.59 
 
 
256 aa  251  7e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0452  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  52.63 
 
 
251 aa  250  2e-65  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0411  CoA enzyme activase  38.67 
 
 
258 aa  142  4e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.882889  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1417  CoA enzyme activase  38.98 
 
 
260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000376879  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2945  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator, putative  38.37 
 
 
248 aa  137  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16070  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.23 
 
 
260 aa  137  2e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1745  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.42 
 
 
261 aa  137  2e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1706  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.21 
 
 
262 aa  135  5e-31  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3161  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  38.69 
 
 
275 aa  135  8e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0040907  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1349  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.24 
 
 
242 aa  134  9.999999999999999e-31  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00045569 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0090  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.22 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1358  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.71 
 
 
244 aa  131  1.0000000000000001e-29  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.512731  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1005  CoA enzyme activase  33.33 
 
 
255 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.350991  hitchhiker  0.000148209 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1326  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.66 
 
 
242 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0887236  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1773  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.87 
 
 
263 aa  130  2.0000000000000002e-29  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.912116  normal  0.454124 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0604  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.72 
 
 
246 aa  129  3e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0200  CoA-substrate-specific enzyme activase  37.11 
 
 
539 aa  129  4.0000000000000003e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000427749  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2023  CoA-substrate-specific enzyme activase  36.89 
 
 
251 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.124243  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25420  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  35.69 
 
 
248 aa  128  8.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000315208  normal  0.628914 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2520  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  40 
 
 
253 aa  125  5e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.491002  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2399  CoA-substrate-specific enzyme activase  36.86 
 
 
272 aa  125  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0864  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  35.77 
 
 
249 aa  125  7e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.224978  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11310  CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  33.46 
 
 
247 aa  125  8.000000000000001e-28  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.45767 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1279  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.03 
 
 
255 aa  123  3e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3160  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.85 
 
 
267 aa  120  9.999999999999999e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0893  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.47 
 
 
273 aa  121  9.999999999999999e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2039  CoA-substrate-specific enzyme activase  37.75 
 
 
256 aa  119  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0987  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.22 
 
 
269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.429759 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0786  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.07 
 
 
274 aa  119  4.9999999999999996e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.260383  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1310  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.89 
 
 
253 aa  119  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1898  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.04 
 
 
539 aa  119  6e-26  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2057  CoA enzyme activase  32.95 
 
 
256 aa  118  9e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.712882 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1148  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.16 
 
 
268 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15664  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1693  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.25 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0546  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.68 
 
 
263 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1468  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.22 
 
 
256 aa  116  3e-25  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0705  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  39.34 
 
 
269 aa  116  3e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.455724 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0272  CoA enzyme activase  38.22 
 
 
268 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.727827  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1347  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  29.55 
 
 
246 aa  116  3.9999999999999997e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3452  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.59 
 
 
261 aa  115  5e-25  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3879  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.09 
 
 
269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1277  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.14 
 
 
259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0885  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.27 
 
 
259 aa  113  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.71068  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4562  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  35.38 
 
 
255 aa  112  6e-24  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3729  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.38 
 
 
255 aa  112  6e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.367049  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4770  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  35.38 
 
 
255 aa  112  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1099  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.17 
 
 
264 aa  111  1.0000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0428  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  37.5 
 
 
256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.215923  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4881  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  35 
 
 
255 aa  110  2.0000000000000002e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.705619  normal  0.786718 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4936  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  34.87 
 
 
255 aa  110  3e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0387  (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  35.42 
 
 
249 aa  108  1e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000890821  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0118  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.33 
 
 
267 aa  107  2e-22  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00112536  hitchhiker  0.00758509 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0632  CoA-substrate-specific enzyme activase domain-containing protein  29.21 
 
 
331 aa  107  2e-22  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1412  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.7 
 
 
272 aa  106  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04203  predicted ATPase, activator of (R)-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase  34.62 
 
 
255 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0419339  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04166  hypothetical protein  34.62 
 
 
255 aa  106  4e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0259899  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5848  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator  34.23 
 
 
255 aa  105  5e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3661  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.62 
 
 
255 aa  105  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0497003  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2868  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.44 
 
 
272 aa  105  7e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2771  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  37.11 
 
 
267 aa  105  7e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0089  CoA enzyme activase  30.92 
 
 
259 aa  104  1e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1928  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.97 
 
 
258 aa  104  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2776  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  36.65 
 
 
272 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0829  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.92 
 
 
254 aa  104  1e-21  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000428387 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0874  (R)-2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase activator (2-hydroxyglutaryl-CoA dehydratase component A)  31.77 
 
 
259 aa  104  2e-21  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3433  CoA-substrate-specific enzyme activase  35.2 
 
 
344 aa  102  7e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1685  CoA-substrate-specific enzyme activase  34.75 
 
 
255 aa  101  9e-21  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.820549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1539  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  31.58 
 
 
1036 aa  101  9e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0619  CoA-substrate-specific enzyme activase  32.04 
 
 
359 aa  100  2e-20  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2772  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.92 
 
 
260 aa  99.8  4e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3911  CoA-substrate-specific enzyme activase  30.89 
 
 
264 aa  99.4  5e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0251  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  35.2 
 
 
320 aa  99  7e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.013721  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0253  CoA-substrate-specific enzyme activase  31.97 
 
 
244 aa  98.2  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1370  CoA enzyme activase  33.17 
 
 
319 aa  97.4  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1133  putative CoA-substrate-specific enzyme activase, putative  29.17 
 
 
259 aa  97.1  2e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000196227  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0726  benzoyl-CoA reductase, subunit A  34.63 
 
 
437 aa  97.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.810305  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1027  benzoyl-CoA reductase, subunit A  34.8 
 
 
437 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.817677  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1536  benzoyl-CoA reductase, subunit A  34.63 
 
 
437 aa  96.7  3e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1829  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.85 
 
 
1021 aa  96.3  4e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0962666  normal  0.086745 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1035  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  33.7 
 
 
327 aa  96.3  4e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1123  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  28.73 
 
 
327 aa  96.3  5e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2218  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.92 
 
 
323 aa  95.9  6e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0354  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  32.64 
 
 
329 aa  95.9  6e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1743  CoA enzyme activase  31.58 
 
 
339 aa  95.5  7e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.386364  normal  0.436212 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_485  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase  30.45 
 
 
283 aa  95.5  7e-19  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0544  BadF/BadG/BcrA/BcrD ATPase family protein  30.45 
 
 
283 aa  95.5  8e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07110  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  34.98 
 
 
331 aa  95.5  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1465  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.92 
 
 
330 aa  93.2  4e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0662  CoA-substrate-specific enzyme activase  29.01 
 
 
319 aa  92.4  7e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00950425  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1977  CoA-substrate-specific enzyme activase  33.17 
 
 
339 aa  92  9e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0628  putative CoA-substrate-specific enzyme activase  30.22 
 
 
336 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0214776  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>