32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4560 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4560  hypothetical protein  100 
 
 		 381 aa  773    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4918  hypothetical protein  32.35 
 
 		 400 aa  174  1.9999999999999998e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4921  hypothetical protein  32.83 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1456  hypothetical protein  28.32 
 
 		 415 aa  123  5e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0787604  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0321  hypothetical protein  27.36 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1411  hypothetical protein  24.1 
 
 		 373 aa  104  3e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586251  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1599  hypothetical protein  23.06 
 
 		 373 aa  103  6e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.848347  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1745  hypothetical protein  23.33 
 
 		 373 aa  103  7e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2338  hypothetical protein  27.5 
 
 		 396 aa  96.3  9e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0451029  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0011  hypothetical protein  28.68 
 
 		 394 aa  92.4  1e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162736  normal  0.742614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0009  hypothetical protein  29.2 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3986  hypothetical protein  28.43 
 
 		 399 aa  90.5  4e-17  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455536  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6358  hypothetical protein  25.92 
 
 		 421 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.171472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2089  hypothetical protein  26.18 
 
 		 427 aa  87.8  3e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0189745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0010  hypothetical protein  29.08 
 
 		 391 aa  87.4  3e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2131  hypothetical protein  26.62 
 
 		 432 aa  87  4e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.347062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2408  hypothetical protein  25.87 
 
 		 432 aa  86.7  6e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0256  hypothetical protein  25.39 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.854321  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2397  hypothetical protein  28.57 
 
 		 403 aa  84.3  0.000000000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0232  hypothetical protein  24.93 
 
 		 404 aa  79  0.0000000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5545  hypothetical protein  25.54 
 
 		 437 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.005595 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2872  hypothetical protein  22.53 
 
 		 411 aa  73.6  0.000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7134  hypothetical protein  29.94 
 
 		 429 aa  68.9  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3018  hypothetical protein  27.74 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188051  normal  0.264335 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0809  hypothetical protein  30.94 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2136  hypothetical protein  30.86 
 
 		 404 aa  67.8  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0967  hypothetical protein  22.4 
 
 		 398 aa  53.5  0.000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474629  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1745  hypothetical protein  22.54 
 
 		 416 aa  49.7  0.00008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1936  hypothetical protein  26.7 
 
 		 392 aa  49.3  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1822  hypothetical protein  22.19 
 
 		 418 aa  49.3  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2146  hypothetical protein  24 
 
 		 393 aa  47.4  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  0.582732 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1390  hypothetical protein  21.76 
 
 		 398 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>