32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1822 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1822  hypothetical protein  100 
 
 
418 aa  843    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1745  hypothetical protein  84.5 
 
 
416 aa  677    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0256  hypothetical protein  34.92 
 
 
391 aa  239  6.999999999999999e-62  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.854321  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2872  hypothetical protein  33.85 
 
 
411 aa  238  2e-61  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0232  hypothetical protein  34.95 
 
 
404 aa  234  2.0000000000000002e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4736  hypothetical protein  36.68 
 
 
417 aa  183  5.0000000000000004e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0967  hypothetical protein  26.5 
 
 
398 aa  175  9.999999999999999e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474629  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1390  hypothetical protein  24.81 
 
 
398 aa  167  2.9999999999999998e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5545  hypothetical protein  29.03 
 
 
437 aa  161  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.005595 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2089  hypothetical protein  29.21 
 
 
427 aa  160  5e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0189745  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2408  hypothetical protein  27.72 
 
 
432 aa  160  5e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6358  hypothetical protein  29.66 
 
 
421 aa  159  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.171472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2131  hypothetical protein  27.72 
 
 
432 aa  158  2e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.347062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7134  hypothetical protein  30.08 
 
 
429 aa  155  1e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4918  hypothetical protein  25.77 
 
 
400 aa  141  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0011  hypothetical protein  27.53 
 
 
394 aa  137  5e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162736  normal  0.742614 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0010  hypothetical protein  26.89 
 
 
391 aa  134  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0009  hypothetical protein  26.8 
 
 
394 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1456  hypothetical protein  26.15 
 
 
415 aa  120  6e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0787604  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4921  hypothetical protein  25.64 
 
 
406 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3018  hypothetical protein  26.82 
 
 
425 aa  106  9e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188051  normal  0.264335 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3986  hypothetical protein  27.13 
 
 
399 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455536  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2338  hypothetical protein  24.68 
 
 
396 aa  92  2e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0451029  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2397  hypothetical protein  25.69 
 
 
403 aa  86.7  8e-16  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69184  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2146  hypothetical protein  23.29 
 
 
393 aa  85.5  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  0.582732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1936  hypothetical protein  24.94 
 
 
392 aa  81.6  0.00000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1411  hypothetical protein  21 
 
 
373 aa  79.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586251  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1745  hypothetical protein  20.73 
 
 
373 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1599  hypothetical protein  20.73 
 
 
373 aa  77  0.0000000000006  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.848347  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0321  hypothetical protein  19.38 
 
 
376 aa  70.5  0.00000000006  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2136  hypothetical protein  29.53 
 
 
404 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0809  hypothetical protein  29.02 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.640121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>