33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2408 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2408  hypothetical protein  100 
 
 		 432 aa  874    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2089  hypothetical protein  86.89 
 
 		 427 aa  749    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0189745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2131  hypothetical protein  99.31 
 
 		 432 aa  868    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.347062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7134  hypothetical protein  55.84 
 
 		 429 aa  408  1e-113  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6358  hypothetical protein  53.27 
 
 		 421 aa  402  1e-111  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.171472 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5545  hypothetical protein  51.31 
 
 		 437 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.005595 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3018  hypothetical protein  44.26 
 
 		 425 aa  316  6e-85  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188051  normal  0.264335 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0256  hypothetical protein  32.49 
 
 		 391 aa  185  1.0000000000000001e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.854321  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2872  hypothetical protein  30 
 
 		 411 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0232  hypothetical protein  32.14 
 
 		 404 aa  179  9e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1822  hypothetical protein  27.72 
 
 		 418 aa  160  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4918  hypothetical protein  25.88 
 
 		 400 aa  158  2e-37  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1456  hypothetical protein  31.14 
 
 		 415 aa  157  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0787604  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1745  hypothetical protein  28.22 
 
 		 416 aa  157  3e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4921  hypothetical protein  29.82 
 
 		 406 aa  155  1e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3986  hypothetical protein  33.75 
 
 		 399 aa  155  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455536  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2338  hypothetical protein  32.85 
 
 		 396 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0451029  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0009  hypothetical protein  29.63 
 
 		 394 aa  145  1e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0011  hypothetical protein  29.95 
 
 		 394 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162736  normal  0.742614 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2397  hypothetical protein  32.52 
 
 		 403 aa  134  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0010  hypothetical protein  28.89 
 
 		 391 aa  130  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1390  hypothetical protein  27.73 
 
 		 398 aa  112  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0967  hypothetical protein  25.83 
 
 		 398 aa  109  1e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474629  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0321  hypothetical protein  25.75 
 
 		 376 aa  105  1e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1411  hypothetical protein  23.66 
 
 		 373 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586251  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1599  hypothetical protein  23.66 
 
 		 373 aa  103  5e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.848347  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1745  hypothetical protein  24.03 
 
 		 373 aa  102  1e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4736  hypothetical protein  26.23 
 
 		 417 aa  99.8  8e-20  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2136  hypothetical protein  29.16 
 
 		 404 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1936  hypothetical protein  26.14 
 
 		 392 aa  81.3  0.00000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0809  hypothetical protein  37.21 
 
 		 404 aa  80.1  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4560  hypothetical protein  25.75 
 
 		 381 aa  76.6  0.0000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2146  hypothetical protein  24.81 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  0.582732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>