32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1745 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1822  hypothetical protein  84.38 
 
 		 418 aa  688    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1745  hypothetical protein  100 
 
 		 416 aa  846    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0256  hypothetical protein  36.75 
 
 		 391 aa  243  3.9999999999999997e-63  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.854321  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2872  hypothetical protein  33.25 
 
 		 411 aa  239  8e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0232  hypothetical protein  36.48 
 
 		 404 aa  238  2e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4736  hypothetical protein  33.75 
 
 		 417 aa  187  2e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2408  hypothetical protein  28.22 
 
 		 432 aa  166  5.9999999999999996e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2089  hypothetical protein  29.6 
 
 		 427 aa  166  8e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0189745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2131  hypothetical protein  28.22 
 
 		 432 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.347062 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0967  hypothetical protein  25.44 
 
 		 398 aa  162  7e-39  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474629  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1390  hypothetical protein  24.38 
 
 		 398 aa  158  2e-37  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6358  hypothetical protein  28.9 
 
 		 421 aa  157  5.0000000000000005e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.171472 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5545  hypothetical protein  28.03 
 
 		 437 aa  153  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.005595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7134  hypothetical protein  28.53 
 
 		 429 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4918  hypothetical protein  26.36 
 
 		 400 aa  143  4e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0009  hypothetical protein  27.62 
 
 		 394 aa  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0011  hypothetical protein  25.4 
 
 		 394 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162736  normal  0.742614 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0010  hypothetical protein  25.13 
 
 		 391 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3018  hypothetical protein  28.17 
 
 		 425 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188051  normal  0.264335 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1456  hypothetical protein  26.75 
 
 		 415 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0787604  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4921  hypothetical protein  26.33 
 
 		 406 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2397  hypothetical protein  25.51 
 
 		 403 aa  102  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69184  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3986  hypothetical protein  26.53 
 
 		 399 aa  99.8  8e-20  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455536  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2146  hypothetical protein  25.58 
 
 		 393 aa  94.4  3e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  0.582732 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2338  hypothetical protein  24.68 
 
 		 396 aa  93.2  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0451029  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1411  hypothetical protein  21.75 
 
 		 373 aa  87.8  3e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586251  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1936  hypothetical protein  24.75 
 
 		 392 aa  85.1  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1745  hypothetical protein  21.22 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1599  hypothetical protein  21.22 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.848347  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0321  hypothetical protein  18.49 
 
 		 376 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2136  hypothetical protein  28.8 
 
 		 404 aa  68.9  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0809  hypothetical protein  28.36 
 
 		 404 aa  67.4  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.640121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>