32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_1390 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004311  BRA0967  hypothetical protein  85.18 
 
 
398 aa  722    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474629  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1390  hypothetical protein  100 
 
 
398 aa  821    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0256  hypothetical protein  31.25 
 
 
391 aa  178  1e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.854321  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2872  hypothetical protein  30.96 
 
 
411 aa  170  3e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0232  hypothetical protein  30.75 
 
 
404 aa  170  5e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1822  hypothetical protein  24.74 
 
 
418 aa  166  5e-40  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1745  hypothetical protein  23.87 
 
 
416 aa  152  1e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6358  hypothetical protein  27.94 
 
 
421 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.171472 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1936  hypothetical protein  27.89 
 
 
392 aa  121  3e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2146  hypothetical protein  26.33 
 
 
393 aa  116  6e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  0.582732 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7134  hypothetical protein  25.38 
 
 
429 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5545  hypothetical protein  26.25 
 
 
437 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.005595 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2131  hypothetical protein  25.91 
 
 
432 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.347062 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4918  hypothetical protein  26.29 
 
 
400 aa  109  7.000000000000001e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2089  hypothetical protein  27.14 
 
 
427 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0189745  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2408  hypothetical protein  27.45 
 
 
432 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4736  hypothetical protein  27.76 
 
 
417 aa  106  7e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1456  hypothetical protein  26.23 
 
 
415 aa  102  1e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0787604  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0009  hypothetical protein  23.44 
 
 
394 aa  79.7  0.00000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3018  hypothetical protein  32.74 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188051  normal  0.264335 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0011  hypothetical protein  21.63 
 
 
394 aa  75.9  0.000000000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162736  normal  0.742614 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0010  hypothetical protein  23.71 
 
 
391 aa  73.6  0.000000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1745  hypothetical protein  23.16 
 
 
373 aa  72.4  0.00000000001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3986  hypothetical protein  26.83 
 
 
399 aa  71.6  0.00000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455536  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2338  hypothetical protein  24.51 
 
 
396 aa  72  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0451029  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1599  hypothetical protein  22.34 
 
 
373 aa  68.2  0.0000000003  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.848347  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2397  hypothetical protein  27.3 
 
 
403 aa  67  0.0000000005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69184  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4921  hypothetical protein  23.76 
 
 
406 aa  66.6  0.0000000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1411  hypothetical protein  22.34 
 
 
373 aa  66.6  0.0000000006  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586251  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0321  hypothetical protein  21.5 
 
 
376 aa  55.5  0.000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2136  hypothetical protein  26.46 
 
 
404 aa  53.5  0.000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0809  hypothetical protein  26.86 
 
 
404 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.640121 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>