33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Jann_2397 on replicon NC_007802
Organism: Jannaschia sp. CCS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007802  Jann_2397  hypothetical protein  100 
 
 
403 aa  800    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69184  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1456  hypothetical protein  57.8 
 
 
415 aa  425  1e-118  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0787604  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3986  hypothetical protein  58.37 
 
 
399 aa  393  1e-108  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455536  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2338  hypothetical protein  55.84 
 
 
396 aa  356  3.9999999999999996e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0451029  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0809  hypothetical protein  41.9 
 
 
404 aa  219  7e-56  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2136  hypothetical protein  41.9 
 
 
404 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4918  hypothetical protein  34.07 
 
 
400 aa  182  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2408  hypothetical protein  32.52 
 
 
432 aa  146  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2131  hypothetical protein  32.52 
 
 
432 aa  146  8.000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.347062 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4921  hypothetical protein  34 
 
 
406 aa  143  5e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2089  hypothetical protein  31.72 
 
 
427 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0189745  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5545  hypothetical protein  32.82 
 
 
437 aa  138  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.005595 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7134  hypothetical protein  33 
 
 
429 aa  131  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6358  hypothetical protein  31.93 
 
 
421 aa  130  3e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.171472 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0009  hypothetical protein  30.69 
 
 
394 aa  124  3e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3018  hypothetical protein  31.03 
 
 
425 aa  123  6e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188051  normal  0.264335 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0010  hypothetical protein  30.73 
 
 
391 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0011  hypothetical protein  29.58 
 
 
394 aa  119  7.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162736  normal  0.742614 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0321  hypothetical protein  24.42 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1745  hypothetical protein  25.51 
 
 
416 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1599  hypothetical protein  23.16 
 
 
373 aa  106  9e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.848347  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1411  hypothetical protein  23.16 
 
 
373 aa  103  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586251  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1745  hypothetical protein  23.16 
 
 
373 aa  101  2e-20  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1822  hypothetical protein  26.67 
 
 
418 aa  102  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0256  hypothetical protein  27.27 
 
 
391 aa  99.4  9e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.854321  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0232  hypothetical protein  27.27 
 
 
404 aa  96.3  9e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4560  hypothetical protein  27.51 
 
 
381 aa  89  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2872  hypothetical protein  25.92 
 
 
411 aa  86.3  8e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0967  hypothetical protein  25.26 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474629  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1390  hypothetical protein  25.72 
 
 
398 aa  76.6  0.0000000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2146  hypothetical protein  27.33 
 
 
393 aa  63.9  0.000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  0.582732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1936  hypothetical protein  27.91 
 
 
392 aa  62.8  0.00000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4736  hypothetical protein  26.86 
 
 
417 aa  57.4  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.954465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>