33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_3986 on replicon NC_008687
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008687  Pden_3986  hypothetical protein  100 
 
 		 399 aa  781    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455536  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1456  hypothetical protein  56.33 
 
 		 415 aa  432  1e-120  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0787604  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2397  hypothetical protein  58.75 
 
 		 403 aa  404  1e-111  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69184  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2338  hypothetical protein  54.38 
 
 		 396 aa  334  1e-90  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0451029  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0809  hypothetical protein  46.55 
 
 		 404 aa  241  1e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2136  hypothetical protein  46.29 
 
 		 404 aa  240  2.9999999999999997e-62  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4918  hypothetical protein  34.63 
 
 		 400 aa  204  2e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2131  hypothetical protein  33.92 
 
 		 432 aa  176  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.347062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2408  hypothetical protein  33.67 
 
 		 432 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2089  hypothetical protein  34 
 
 		 427 aa  170  4e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0189745  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4921  hypothetical protein  32.85 
 
 		 406 aa  169  9e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5545  hypothetical protein  35.16 
 
 		 437 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.005595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6358  hypothetical protein  33.91 
 
 		 421 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.171472 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7134  hypothetical protein  33.82 
 
 		 429 aa  144  2e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0256  hypothetical protein  28.64 
 
 		 391 aa  124  3e-27  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.854321  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0232  hypothetical protein  28.64 
 
 		 404 aa  121  1.9999999999999998e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0009  hypothetical protein  27.13 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3018  hypothetical protein  29.49 
 
 		 425 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188051  normal  0.264335 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2872  hypothetical protein  26.09 
 
 		 411 aa  115  2.0000000000000002e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0011  hypothetical protein  28.57 
 
 		 394 aa  114  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162736  normal  0.742614 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1599  hypothetical protein  21.58 
 
 		 373 aa  113  7.000000000000001e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.848347  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0010  hypothetical protein  27.54 
 
 		 391 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1411  hypothetical protein  21.78 
 
 		 373 aa  110  3e-23  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586251  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1745  hypothetical protein  22.39 
 
 		 373 aa  108  1e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0321  hypothetical protein  25.2 
 
 		 376 aa  106  7e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1745  hypothetical protein  27.11 
 
 		 416 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1822  hypothetical protein  27.39 
 
 		 418 aa  102  1e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4560  hypothetical protein  27.86 
 
 		 381 aa  96.7  6e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0967  hypothetical protein  23.22 
 
 		 398 aa  84  0.000000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474629  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1390  hypothetical protein  25.27 
 
 		 398 aa  77.4  0.0000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2146  hypothetical protein  27.95 
 
 		 393 aa  72  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  0.582732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1936  hypothetical protein  23.95 
 
 		 392 aa  70.9  0.00000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4736  hypothetical protein  22.87 
 
 		 417 aa  62.4  0.00000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.954465 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>