33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4918 on replicon NC_007949
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007949  Bpro_4918  hypothetical protein  100 
 
 		 400 aa  828    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4921  hypothetical protein  39.03 
 
 		 406 aa  241  2e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1456  hypothetical protein  33.5 
 
 		 415 aa  201  3e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0787604  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3986  hypothetical protein  34.35 
 
 		 399 aa  184  3e-45  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455536  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2338  hypothetical protein  32.08 
 
 		 396 aa  178  1e-43  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0451029  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5545  hypothetical protein  30.15 
 
 		 437 aa  168  2e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.005595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2397  hypothetical protein  33.17 
 
 		 403 aa  166  6.9999999999999995e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69184  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7134  hypothetical protein  28.15 
 
 		 429 aa  162  1e-38  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2089  hypothetical protein  27.07 
 
 		 427 aa  160  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0189745  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6358  hypothetical protein  28.61 
 
 		 421 aa  159  9e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.171472 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2408  hypothetical protein  25.88 
 
 		 432 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2131  hypothetical protein  25.63 
 
 		 432 aa  154  2e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.347062 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4560  hypothetical protein  30.3 
 
 		 381 aa  153  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0321  hypothetical protein  27.34 
 
 		 376 aa  153  5.9999999999999996e-36  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1822  hypothetical protein  25.77 
 
 		 418 aa  141  3e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1745  hypothetical protein  26.49 
 
 		 373 aa  140  4.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1599  hypothetical protein  26.74 
 
 		 373 aa  139  7.999999999999999e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.848347  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1745  hypothetical protein  24.94 
 
 		 416 aa  136  6.0000000000000005e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1411  hypothetical protein  26.22 
 
 		 373 aa  136  7.000000000000001e-31  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586251  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0256  hypothetical protein  26.23 
 
 		 391 aa  135  1.9999999999999998e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.854321  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0232  hypothetical protein  26.3 
 
 		 404 aa  130  3e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0009  hypothetical protein  27.79 
 
 		 394 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2872  hypothetical protein  25.32 
 
 		 411 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2136  hypothetical protein  31.86 
 
 		 404 aa  124  3e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0011  hypothetical protein  26.49 
 
 		 394 aa  121  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162736  normal  0.742614 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0010  hypothetical protein  26.37 
 
 		 391 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0809  hypothetical protein  41.29 
 
 		 404 aa  112  2.0000000000000002e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3018  hypothetical protein  25.64 
 
 		 425 aa  110  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188051  normal  0.264335 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1390  hypothetical protein  26.29 
 
 		 398 aa  109  7.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0967  hypothetical protein  27.04 
 
 		 398 aa  105  1e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474629  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4736  hypothetical protein  26.26 
 
 		 417 aa  65.5  0.000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1936  hypothetical protein  22.56 
 
 		 392 aa  54.7  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2146  hypothetical protein  21.95 
 
 		 393 aa  53.1  0.000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  0.582732 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>