33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2089 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_2408  hypothetical protein  86.89 
 
 
432 aa  735    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2089  hypothetical protein  100 
 
 
427 aa  854    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0189745  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2131  hypothetical protein  87.35 
 
 
432 aa  738    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.347062 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7134  hypothetical protein  57.67 
 
 
429 aa  422  1e-117  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5545  hypothetical protein  55 
 
 
437 aa  424  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.005595 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6358  hypothetical protein  54.87 
 
 
421 aa  413  1e-114  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.171472 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3018  hypothetical protein  42.45 
 
 
425 aa  302  8.000000000000001e-81  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188051  normal  0.264335 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0256  hypothetical protein  32.15 
 
 
391 aa  182  7e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.854321  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0232  hypothetical protein  31.9 
 
 
404 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2872  hypothetical protein  30.07 
 
 
411 aa  172  6.999999999999999e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1456  hypothetical protein  32.24 
 
 
415 aa  161  2e-38  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0787604  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4918  hypothetical protein  27.07 
 
 
400 aa  160  3e-38  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1822  hypothetical protein  29.21 
 
 
418 aa  160  4e-38  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1745  hypothetical protein  29.6 
 
 
416 aa  154  4e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4921  hypothetical protein  30.84 
 
 
406 aa  149  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3986  hypothetical protein  33.83 
 
 
399 aa  148  2.0000000000000003e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455536  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2338  hypothetical protein  33 
 
 
396 aa  144  3e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0451029  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0009  hypothetical protein  30.49 
 
 
394 aa  140  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0011  hypothetical protein  31.46 
 
 
394 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162736  normal  0.742614 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0010  hypothetical protein  29.35 
 
 
391 aa  135  9.999999999999999e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2397  hypothetical protein  30.99 
 
 
403 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69184  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1390  hypothetical protein  27.14 
 
 
398 aa  109  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1411  hypothetical protein  26.03 
 
 
373 aa  107  4e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586251  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4736  hypothetical protein  28.57 
 
 
417 aa  107  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.954465 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1599  hypothetical protein  25.79 
 
 
373 aa  105  2e-21  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.848347  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0967  hypothetical protein  25.82 
 
 
398 aa  104  3e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474629  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0321  hypothetical protein  25.25 
 
 
376 aa  104  3e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1745  hypothetical protein  25.91 
 
 
373 aa  103  5e-21  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1936  hypothetical protein  27.71 
 
 
392 aa  90.9  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2146  hypothetical protein  25.63 
 
 
393 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  0.582732 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2136  hypothetical protein  27.8 
 
 
404 aa  78.6  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0809  hypothetical protein  36.78 
 
 
404 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4560  hypothetical protein  24.38 
 
 
381 aa  70.9  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539028 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>