32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJJ81176_1411 on replicon NC_008787
Organism: Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE1599  hypothetical protein  98.93 
 
 
373 aa  753    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.848347  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1745  hypothetical protein  96.51 
 
 
373 aa  714    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1411  hypothetical protein  100 
 
 
373 aa  760    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.586251  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0321  hypothetical protein  60.11 
 
 
376 aa  417  9.999999999999999e-116  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4918  hypothetical protein  26.22 
 
 
400 aa  144  2e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_4921  hypothetical protein  24.37 
 
 
406 aa  134  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1456  hypothetical protein  28.61 
 
 
415 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0787604  normal  0.420698 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2089  hypothetical protein  26.03 
 
 
427 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0189745  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2131  hypothetical protein  24.75 
 
 
432 aa  110  5e-23  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.347062 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2408  hypothetical protein  24.75 
 
 
432 aa  110  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.27935 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3986  hypothetical protein  22.83 
 
 
399 aa  97.8  3e-19  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.455536  normal  0.232162 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5545  hypothetical protein  23.92 
 
 
437 aa  90.1  6e-17  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  decreased coverage  0.005595 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2397  hypothetical protein  22.94 
 
 
403 aa  89.4  9e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.69184  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0009  hypothetical protein  22.08 
 
 
394 aa  89.4  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1745  hypothetical protein  21.75 
 
 
416 aa  87.4  4e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2338  hypothetical protein  23.12 
 
 
396 aa  85.5  0.000000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0451029  normal  0.318955 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2872  hypothetical protein  20.1 
 
 
411 aa  83.6  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1822  hypothetical protein  20.93 
 
 
418 aa  82.8  0.000000000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.451592 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0011  hypothetical protein  20.77 
 
 
394 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162736  normal  0.742614 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4560  hypothetical protein  26.21 
 
 
381 aa  81.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.539028 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0256  hypothetical protein  21.13 
 
 
391 aa  81.3  0.00000000000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.854321  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7134  hypothetical protein  21.55 
 
 
429 aa  80.9  0.00000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.488446  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3018  hypothetical protein  24.13 
 
 
425 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.188051  normal  0.264335 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6358  hypothetical protein  28.26 
 
 
421 aa  77.8  0.0000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.171472 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0010  hypothetical protein  21.07 
 
 
391 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0232  hypothetical protein  20.73 
 
 
404 aa  75.1  0.000000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0967  hypothetical protein  20.85 
 
 
398 aa  74.7  0.000000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0474629  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1390  hypothetical protein  22.34 
 
 
398 aa  72  0.00000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0809  hypothetical protein  25.82 
 
 
404 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.640121 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2136  hypothetical protein  25.82 
 
 
404 aa  65.5  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2146  hypothetical protein  22.29 
 
 
393 aa  50.8  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.139768  normal  0.582732 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1936  hypothetical protein  20.57 
 
 
392 aa  48.5  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>