22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4433 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4433  hydrolase  100 
 
 		 791 aa  1580    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2637  hypothetical protein  31.13 
 
 		 813 aa  169  2e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5889  HAD family hydrolase  28.31 
 
 		 863 aa  158  3e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0387615  normal  0.138972 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0725  HAD superfamily hydrolase-like  27.66 
 
 		 862 aa  155  2e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237174  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0758  hypothetical protein  29.58 
 
 		 811 aa  135  3e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0705  hypothetical protein  28.15 
 
 		 800 aa  133  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0850  putative glycosyl transferase  22.73 
 
 		 649 aa  100  1e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  hitchhiker  0.00000136346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0883  putative glycosyl transferase  22.73 
 
 		 649 aa  99.8  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358667 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0786  putative glycosyl transferase  23.04 
 
 		 649 aa  96.3  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0373928 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15990  hydrolase (HAD superfamily) protein  26.08 
 
 		 612 aa  94.7  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2998  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.33 
 
 		 588 aa  94  1e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0193  HAD superfamily hydrolase-like protein  23.46 
 
 		 608 aa  84.7  0.000000000000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3902  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  27.68 
 
 		 664 aa  75.5  0.000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1592  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  25.41 
 
 		 1147 aa  68.6  0.0000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3340  HAD superfamily hydrolase-like protein  21.85 
 
 		 726 aa  68.9  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4891  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.99 
 
 		 1867 aa  65.1  0.000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4177  HAD superfamily hydrolase-like protein  22.66 
 
 		 719 aa  64.3  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4551  hydrolase  28.64 
 
 		 254 aa  59.7  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.282317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2510  hypothetical protein  34.78 
 
 		 470 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2172  hypothetical protein  25 
 
 		 483 aa  55.1  0.000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2295  putative phosphoglycolate phosphatase  35.11 
 
 		 234 aa  45.4  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.768888 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3008  HAD superfamily hydrolase-like protein  25.23 
 
 		 260 aa  44.3  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.254184  hitchhiker  0.00785062 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>