18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2172 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007484  Noc_2172  hypothetical protein  100 
 
 		 483 aa  998    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2510  hypothetical protein  42.49 
 
 		 470 aa  206  1e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2513  hypothetical protein  36.84 
 
 		 232 aa  130  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.71537 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1023  hypothetical protein  24.49 
 
 		 588 aa  100  7e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221592  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2508  hypothetical protein  27.3 
 
 		 455 aa  84  0.000000000000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0786  putative glycosyl transferase  20.56 
 
 		 649 aa  73.9  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0373928 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0850  putative glycosyl transferase  20.56 
 
 		 649 aa  73.6  0.000000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  hitchhiker  0.00000136346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0883  putative glycosyl transferase  20.33 
 
 		 649 aa  72.4  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358667 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5889  HAD family hydrolase  23.98 
 
 		 863 aa  68.9  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0387615  normal  0.138972 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2998  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.29 
 
 		 588 aa  67.4  0.0000000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211302  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15990  hydrolase (HAD superfamily) protein  25.88 
 
 		 612 aa  61.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0725  HAD superfamily hydrolase-like  24.27 
 
 		 862 aa  60.8  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.237174  normal  0.0738114 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4177  HAD superfamily hydrolase-like protein  25.89 
 
 		 719 aa  56.2  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4433  hydrolase  24.6 
 
 		 791 aa  55.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0193  HAD superfamily hydrolase-like protein  26.53 
 
 		 608 aa  52.4  0.00002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2637  hypothetical protein  24.44 
 
 		 813 aa  47.4  0.0007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1592  Capsule polysaccharide biosynthesis protein  27.14 
 
 		 1147 aa  44.3  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.80092 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0758  hypothetical protein  29.66 
 
 		 811 aa  43.9  0.007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>