13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_1023 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_1023  hypothetical protein  100 
 
 		 588 aa  1200    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.00221592  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2172  hypothetical protein  22.93 
 
 		 483 aa  102  2e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2510  hypothetical protein  22.96 
 
 		 470 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2508  hypothetical protein  22.17 
 
 		 455 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2173  hypothetical protein  26.67 
 
 		 209 aa  59.3  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4891  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.09 
 
 		 1867 aa  58.5  0.0000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3902  hydrolase (HAD superfamily)-like protein  27.65 
 
 		 664 aa  57  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4177  HAD superfamily hydrolase-like protein  25.12 
 
 		 719 aa  50.8  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0850  putative glycosyl transferase  22.29 
 
 		 649 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.996088  hitchhiker  0.00000136346 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0883  putative glycosyl transferase  22.55 
 
 		 649 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.358667 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0786  putative glycosyl transferase  22.29 
 
 		 649 aa  48.1  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0373928 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2513  hypothetical protein  18.45 
 
 		 232 aa  45.4  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.71537 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2998  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  21.67 
 
 		 588 aa  45.1  0.003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.211302  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>