22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4365 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4365  amine dehydrogenase  100 
 
 		 185 aa  376  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.840344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1688  amine dehydrogenase  74.05 
 
 		 186 aa  283  1.0000000000000001e-75  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.523749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0157  twin-arginine translocation pathway signal  61.29 
 
 		 185 aa  233  1.0000000000000001e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.436355  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0560  amine dehydrogenase  63.39 
 
 		 177 aa  231  5e-60  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3251  amine dehydrogenase  60.22 
 
 		 167 aa  218  3e-56  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0519342  hitchhiker  0.00250111 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3821  methylamine dehydrogenase light chain  54.14 
 
 		 173 aa  204  6e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2653  amine dehydrogenase  52.25 
 
 		 184 aa  203  1e-51  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.18475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2221  amine dehydrogenase  54.89 
 
 		 173 aa  201  6e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5225  amine dehydrogenase  54.95 
 
 		 181 aa  197  6e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3812  amine dehydrogenase  51.38 
 
 		 181 aa  195  4.0000000000000005e-49  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.701995 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4469  amine dehydrogenase  52.49 
 
 		 181 aa  194  7e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3583  amine dehydrogenase  51.93 
 
 		 181 aa  194  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.826379 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3308  amine dehydrogenase  53.59 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5059  amine dehydrogenase  53.59 
 
 		 178 aa  193  1e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.54485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0604  amine dehydrogenase  51.93 
 
 		 181 aa  192  3e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4994  amine dehydrogenase  51.93 
 
 		 181 aa  192  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.020771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4077  amine dehydrogenase  50 
 
 		 171 aa  191  6e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0551  amine dehydrogenase  45.16 
 
 		 186 aa  177  1e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.948823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0036  methylamine dehydrogenase light chain  48.04 
 
 		 194 aa  164  5e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.195732  hitchhiker  0.00745066 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0562  methylamine dehydrogenase light chain  42.86 
 
 		 186 aa  162  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4733  methylamine dehydrogenase light chain  42.31 
 
 		 188 aa  160  1e-38  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.059407  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2337  Amine dehydrogenase  47.72 
 
 		 195 aa  138  4.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>