22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_5225 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_5225  amine dehydrogenase  100 
 
 
181 aa  370  1e-102  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4469  amine dehydrogenase  97.24 
 
 
181 aa  324  5e-88  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3583  amine dehydrogenase  96.13 
 
 
181 aa  323  1e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.826379 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0604  amine dehydrogenase  96.13 
 
 
181 aa  322  2e-87  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3308  amine dehydrogenase  97.24 
 
 
178 aa  322  2e-87  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5059  amine dehydrogenase  97.24 
 
 
178 aa  322  2e-87  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.54485  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4994  amine dehydrogenase  96.13 
 
 
181 aa  321  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.020771  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3812  amine dehydrogenase  94.48 
 
 
181 aa  320  5e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.701995 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4077  amine dehydrogenase  57.06 
 
 
171 aa  224  7e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2221  amine dehydrogenase  55 
 
 
173 aa  206  1e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2653  amine dehydrogenase  51.12 
 
 
184 aa  205  4e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.18475  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1688  amine dehydrogenase  56.68 
 
 
186 aa  204  5e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.523749  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0157  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 
185 aa  197  7.999999999999999e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.436355  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3251  amine dehydrogenase  54.44 
 
 
167 aa  194  7e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0519342  hitchhiker  0.00250111 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4365  amine dehydrogenase  54.95 
 
 
185 aa  185  3e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.840344  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3821  methylamine dehydrogenase light chain  49.44 
 
 
173 aa  184  5e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0551  amine dehydrogenase  50.28 
 
 
186 aa  184  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.948823  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0560  amine dehydrogenase  50.83 
 
 
177 aa  182  3e-45  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4733  methylamine dehydrogenase light chain  42.54 
 
 
188 aa  156  1e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.059407  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0562  methylamine dehydrogenase light chain  41.53 
 
 
186 aa  154  8e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0036  methylamine dehydrogenase light chain  48.33 
 
 
194 aa  152  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.195732  hitchhiker  0.00745066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2337  Amine dehydrogenase  45.24 
 
 
195 aa  137  8.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>