22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3251 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3251  amine dehydrogenase  100 
 
 		 167 aa  343  5e-94  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0519342  hitchhiker  0.00250111 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3821  methylamine dehydrogenase light chain  65.32 
 
 		 173 aa  236  1e-61  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4365  amine dehydrogenase  64.9 
 
 		 185 aa  203  8e-52  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.840344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1688  amine dehydrogenase  57.69 
 
 		 186 aa  203  9e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.523749  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2221  amine dehydrogenase  57.8 
 
 		 173 aa  203  1e-51  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0560  amine dehydrogenase  59.54 
 
 		 177 aa  195  2.0000000000000003e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3812  amine dehydrogenase  52.78 
 
 		 181 aa  188  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.701995 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5225  amine dehydrogenase  52.22 
 
 		 181 aa  187  4e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0157  twin-arginine translocation pathway signal  52.46 
 
 		 185 aa  188  4e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.436355  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4994  amine dehydrogenase  53.89 
 
 		 181 aa  185  2e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.020771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0604  amine dehydrogenase  52.78 
 
 		 181 aa  184  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3583  amine dehydrogenase  53.33 
 
 		 181 aa  184  4e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.826379 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5059  amine dehydrogenase  53.67 
 
 		 178 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.54485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3308  amine dehydrogenase  53.67 
 
 		 178 aa  184  4e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4469  amine dehydrogenase  53.33 
 
 		 181 aa  184  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4077  amine dehydrogenase  50 
 
 		 171 aa  184  6e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2653  amine dehydrogenase  45.51 
 
 		 184 aa  165  2e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.18475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0551  amine dehydrogenase  46.41 
 
 		 186 aa  164  4e-40  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.948823  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0562  methylamine dehydrogenase light chain  44.75 
 
 		 186 aa  157  9e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4733  methylamine dehydrogenase light chain  43.96 
 
 		 188 aa  152  2e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.059407  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0036  methylamine dehydrogenase light chain  43.33 
 
 		 194 aa  151  4e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.195732  hitchhiker  0.00745066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2337  Amine dehydrogenase  45.6 
 
 		 195 aa  137  7.999999999999999e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>