22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_4994 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010552  BamMC406_4994  amine dehydrogenase  100 
 
 		 181 aa  370  1e-102  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.020771  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0604  amine dehydrogenase  98.9 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4469  amine dehydrogenase  98.9 
 
 		 181 aa  367  1e-101  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5225  amine dehydrogenase  96.13 
 
 		 181 aa  333  5e-91  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3583  amine dehydrogenase  97.24 
 
 		 181 aa  324  5e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.826379 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3812  amine dehydrogenase  95.58 
 
 		 181 aa  323  7e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.701995 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3308  amine dehydrogenase  93.92 
 
 		 178 aa  318  3e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5059  amine dehydrogenase  93.92 
 
 		 178 aa  318  3e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.54485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4077  amine dehydrogenase  57.06 
 
 		 171 aa  223  8e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2653  amine dehydrogenase  52.81 
 
 		 184 aa  211  4.9999999999999996e-54  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.18475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1688  amine dehydrogenase  55.49 
 
 		 186 aa  206  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.523749  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2221  amine dehydrogenase  54.44 
 
 		 173 aa  205  3e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0157  twin-arginine translocation pathway signal  50 
 
 		 185 aa  198  3e-50  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.436355  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3251  amine dehydrogenase  54.44 
 
 		 167 aa  196  2.0000000000000003e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0519342  hitchhiker  0.00250111 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3821  methylamine dehydrogenase light chain  48.89 
 
 		 173 aa  184  4e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4365  amine dehydrogenase  53.85 
 
 		 185 aa  182  3e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.840344  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0551  amine dehydrogenase  48.6 
 
 		 186 aa  181  4.0000000000000006e-45  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.948823  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0560  amine dehydrogenase  49.72 
 
 		 177 aa  180  1e-44  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0562  methylamine dehydrogenase light chain  41.34 
 
 		 186 aa  156  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4733  methylamine dehydrogenase light chain  40.98 
 
 		 188 aa  152  2.9999999999999998e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.059407  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0036  methylamine dehydrogenase light chain  46.37 
 
 		 194 aa  152  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.195732  hitchhiker  0.00745066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2337  Amine dehydrogenase  42.71 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>