22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_2337 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_2337  Amine dehydrogenase  100 
 
 
195 aa  390  1e-108  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0036  methylamine dehydrogenase light chain  56.7 
 
 
194 aa  199  3e-50  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.195732  hitchhiker  0.00745066 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1688  amine dehydrogenase  50 
 
 
186 aa  176  2e-43  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.523749  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0560  amine dehydrogenase  51.55 
 
 
177 aa  176  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2221  amine dehydrogenase  46.11 
 
 
173 aa  174  9e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0551  amine dehydrogenase  43.46 
 
 
186 aa  171  5.999999999999999e-42  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.948823  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4077  amine dehydrogenase  44.68 
 
 
171 aa  171  9e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3821  methylamine dehydrogenase light chain  44.74 
 
 
173 aa  170  1e-41  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2653  amine dehydrogenase  44.04 
 
 
184 aa  169  2e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.18475  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3251  amine dehydrogenase  45.6 
 
 
167 aa  169  3e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0519342  hitchhiker  0.00250111 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0562  methylamine dehydrogenase light chain  41.75 
 
 
186 aa  164  5e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4733  methylamine dehydrogenase light chain  43.46 
 
 
188 aa  163  1.0000000000000001e-39  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.059407  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3812  amine dehydrogenase  42.19 
 
 
181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.701995 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5225  amine dehydrogenase  43.23 
 
 
181 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4365  amine dehydrogenase  47.67 
 
 
185 aa  159  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.840344  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4469  amine dehydrogenase  42.19 
 
 
181 aa  159  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3583  amine dehydrogenase  42.71 
 
 
181 aa  158  4e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.826379 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0157  twin-arginine translocation pathway signal  41.84 
 
 
185 aa  158  4e-38  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.436355  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4994  amine dehydrogenase  42.19 
 
 
181 aa  158  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.020771  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5059  amine dehydrogenase  41.67 
 
 
178 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.54485  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3308  amine dehydrogenase  41.67 
 
 
178 aa  157  7e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0604  amine dehydrogenase  41.67 
 
 
181 aa  157  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>