22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4077 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007348  Reut_B4077  amine dehydrogenase  100 
 
 
171 aa  358  3e-98  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2653  amine dehydrogenase  61.33 
 
 
184 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.18475  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5225  amine dehydrogenase  57.63 
 
 
181 aa  225  2e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3308  amine dehydrogenase  58.05 
 
 
178 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5059  amine dehydrogenase  58.05 
 
 
178 aa  221  4e-57  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.54485  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3812  amine dehydrogenase  57.06 
 
 
181 aa  221  4.9999999999999996e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.701995 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4469  amine dehydrogenase  56.5 
 
 
181 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3583  amine dehydrogenase  56.5 
 
 
181 aa  219  9.999999999999999e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.826379 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0604  amine dehydrogenase  55.93 
 
 
181 aa  218  3e-56  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4994  amine dehydrogenase  55.93 
 
 
181 aa  218  3.9999999999999997e-56  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.020771  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2221  amine dehydrogenase  57.99 
 
 
173 aa  214  5.9999999999999996e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0157  twin-arginine translocation pathway signal  50.56 
 
 
185 aa  195  3e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.436355  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1688  amine dehydrogenase  49.72 
 
 
186 aa  191  3e-48  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.523749  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3251  amine dehydrogenase  50 
 
 
167 aa  186  2e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0519342  hitchhiker  0.00250111 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0560  amine dehydrogenase  52.38 
 
 
177 aa  185  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3821  methylamine dehydrogenase light chain  48.5 
 
 
173 aa  181  6e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4365  amine dehydrogenase  50.85 
 
 
185 aa  176  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.840344  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0551  amine dehydrogenase  46.33 
 
 
186 aa  172  9.999999999999999e-43  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.948823  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4733  methylamine dehydrogenase light chain  40.78 
 
 
188 aa  155  2e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.059407  normal  0.180751 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0562  methylamine dehydrogenase light chain  41.24 
 
 
186 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0036  methylamine dehydrogenase light chain  40.78 
 
 
194 aa  147  9e-35  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.195732  hitchhiker  0.00745066 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2337  Amine dehydrogenase  42.02 
 
 
195 aa  137  7e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>