38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_2823 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_2823  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  333  7.999999999999999e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2989  hypothetical protein  59.44 
 
 		 159 aa  158  3e-38  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0369405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0242  hypothetical protein  50.97 
 
 		 167 aa  148  3e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1144  hypothetical protein  49.06 
 
 		 170 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.896319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2789  protein of unknown function DUF1052  51.77 
 
 		 161 aa  127  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.542945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2667  hypothetical protein  49.65 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2894  protein of unknown function DUF1052  49.65 
 
 		 161 aa  124  5e-28  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.696295  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1437  hypothetical protein  47.76 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1054  protein of unknown function DUF1052  48.23 
 
 		 180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0021  hypothetical protein  44.3 
 
 		 162 aa  114  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0469027  normal  0.0489238 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0151  hypothetical protein  49.62 
 
 		 164 aa  114  8.999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0307  hypothetical protein  50.35 
 
 		 152 aa  111  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645888  normal  0.0582971 
 
 
-
 
NC_004310  BR0138  hypothetical protein  50.76 
 
 		 164 aa  107  9.000000000000001e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0132  hypothetical protein  50.76 
 
 		 176 aa  107  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00369415  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0068  hypothetical protein  41.13 
 
 		 157 aa  103  1e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3988  protein of unknown function DUF1052  41.56 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4316  protein of unknown function DUF1052  40.91 
 
 		 164 aa  98.2  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0131225  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4208  hypothetical protein  45.32 
 
 		 152 aa  97.8  5e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2157  protein of unknown function DUF1052  46.38 
 
 		 161 aa  97.8  5e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2903  hypothetical protein  48.84 
 
 		 165 aa  97.4  9e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2244  hypothetical protein  44.8 
 
 		 146 aa  96.7  1e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3272  hypothetical protein  43.7 
 
 		 174 aa  97.1  1e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4040  hypothetical protein  48.53 
 
 		 182 aa  97.1  1e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612895  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3406  hypothetical protein  43.08 
 
 		 150 aa  97.1  1e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0751  hypothetical protein  45.45 
 
 		 167 aa  96.7  1e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2407  hypothetical protein  45.45 
 
 		 155 aa  95.9  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2122  hypothetical protein  43.26 
 
 		 155 aa  95.9  3e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.653623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0425  hypothetical protein  44.52 
 
 		 167 aa  95.1  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.844666  normal  0.0652536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7672  hypothetical protein  39.86 
 
 		 160 aa  92.4  2e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0573  protein of unknown function DUF1052  42.55 
 
 		 152 aa  92.8  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0132  hypothetical protein  42.55 
 
 		 159 aa  90.9  7e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0232  hypothetical protein  45.07 
 
 		 163 aa  90.5  1e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0717  hypothetical protein  42.18 
 
 		 159 aa  89.7  2e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0062  hypothetical protein  41.96 
 
 		 186 aa  89.4  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0375  hypothetical protein  44.2 
 
 		 160 aa  88.6  4e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0112  hypothetical protein  42.57 
 
 		 163 aa  85.9  2e-16  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1550  hypothetical protein  37.74 
 
 		 158 aa  85.5  3e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0501323 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3412  hypothetical protein  38.36 
 
 		 165 aa  75.5  0.0000000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>