38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_1550 on replicon NC_008686
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008686  Pden_1550  hypothetical protein  100 
 
 		 158 aa  313  5e-85  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0501323 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2122  hypothetical protein  61.48 
 
 		 155 aa  176  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.653623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0425  hypothetical protein  56.13 
 
 		 167 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.844666  normal  0.0652536 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2407  hypothetical protein  57.93 
 
 		 155 aa  166  8e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0751  hypothetical protein  57.24 
 
 		 167 aa  166  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3406  hypothetical protein  52.7 
 
 		 150 aa  157  5e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2244  hypothetical protein  57.78 
 
 		 146 aa  147  4e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0021  hypothetical protein  47.33 
 
 		 162 aa  125  2.0000000000000002e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0469027  normal  0.0489238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1054  protein of unknown function DUF1052  47.29 
 
 		 180 aa  122  3e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0138  hypothetical protein  48 
 
 		 164 aa  117  4.9999999999999996e-26  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1144  hypothetical protein  44.6 
 
 		 170 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.896319 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0132  hypothetical protein  48 
 
 		 176 aa  117  6e-26  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00369415  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3272  hypothetical protein  45.24 
 
 		 174 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0062  hypothetical protein  46.03 
 
 		 186 aa  114  6e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2789  protein of unknown function DUF1052  44.78 
 
 		 161 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.542945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2667  hypothetical protein  44.03 
 
 		 176 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2903  hypothetical protein  45.31 
 
 		 165 aa  111  3e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2894  protein of unknown function DUF1052  44.03 
 
 		 161 aa  112  3e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.696295  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1437  hypothetical protein  48.15 
 
 		 158 aa  110  6e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0307  hypothetical protein  44.78 
 
 		 152 aa  110  8.000000000000001e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645888  normal  0.0582971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0717  hypothetical protein  40.14 
 
 		 159 aa  109  1.0000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0151  hypothetical protein  44.72 
 
 		 164 aa  108  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4208  hypothetical protein  45.16 
 
 		 152 aa  108  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4316  protein of unknown function DUF1052  41.94 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0131225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0573  protein of unknown function DUF1052  40.14 
 
 		 152 aa  108  4.0000000000000004e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4040  hypothetical protein  44.8 
 
 		 182 aa  107  5e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612895  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0132  hypothetical protein  39.04 
 
 		 159 aa  107  5e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0068  hypothetical protein  39.39 
 
 		 157 aa  105  2e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3988  protein of unknown function DUF1052  41.94 
 
 		 164 aa  105  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0112  hypothetical protein  42.11 
 
 		 163 aa  105  3e-22  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0375  hypothetical protein  41.48 
 
 		 160 aa  104  5e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7672  hypothetical protein  39.1 
 
 		 160 aa  103  1e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0232  hypothetical protein  39.85 
 
 		 163 aa  102  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2157  protein of unknown function DUF1052  39.26 
 
 		 161 aa  99.4  2e-20  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2989  hypothetical protein  39.44 
 
 		 159 aa  95.1  4e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0369405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0242  hypothetical protein  38.69 
 
 		 167 aa  93.6  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2823  hypothetical protein  39.42 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3412  hypothetical protein  35.25 
 
 		 165 aa  79  0.00000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>