38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rsph17025_0425 on replicon NC_009428
Organism: Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009428  Rsph17025_0425  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  333  7.999999999999999e-91  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.844666  normal  0.0652536 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0751  hypothetical protein  81.44 
 
 		 167 aa  276  1e-73  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2407  hypothetical protein  83.23 
 
 		 155 aa  265  2e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2122  hypothetical protein  68.61 
 
 		 155 aa  198  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.653623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3406  hypothetical protein  66.43 
 
 		 150 aa  194  4.0000000000000005e-49  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2244  hypothetical protein  73.72 
 
 		 146 aa  189  2e-47  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1550  hypothetical protein  56.13 
 
 		 158 aa  171  2.9999999999999996e-42  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0501323 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0068  hypothetical protein  50 
 
 		 157 aa  130  6.999999999999999e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0021  hypothetical protein  48.85 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0469027  normal  0.0489238 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2157  protein of unknown function DUF1052  50.37 
 
 		 161 aa  128  5.0000000000000004e-29  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1054  protein of unknown function DUF1052  50 
 
 		 180 aa  121  4e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3272  hypothetical protein  50 
 
 		 174 aa  121  4e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0307  hypothetical protein  49.25 
 
 		 152 aa  119  9.999999999999999e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645888  normal  0.0582971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0717  hypothetical protein  47.06 
 
 		 159 aa  119  3e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2789  protein of unknown function DUF1052  47.76 
 
 		 161 aa  118  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.542945 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2903  hypothetical protein  46.67 
 
 		 165 aa  117  9.999999999999999e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4208  hypothetical protein  46.51 
 
 		 152 aa  116  9.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2894  protein of unknown function DUF1052  47.01 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.696295  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2667  hypothetical protein  44.08 
 
 		 176 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1144  hypothetical protein  47.41 
 
 		 170 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.896319 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0232  hypothetical protein  44 
 
 		 163 aa  115  3.9999999999999997e-25  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7672  hypothetical protein  45.04 
 
 		 160 aa  114  7.999999999999999e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0132  hypothetical protein  46.32 
 
 		 176 aa  114  7.999999999999999e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00369415  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0112  hypothetical protein  47.33 
 
 		 163 aa  114  8.999999999999998e-25  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_004310  BR0138  hypothetical protein  46.32 
 
 		 164 aa  113  1.0000000000000001e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0375  hypothetical protein  46.67 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0132  hypothetical protein  45.45 
 
 		 159 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0573  protein of unknown function DUF1052  45.19 
 
 		 152 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4040  hypothetical protein  51.2 
 
 		 182 aa  110  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612895  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0151  hypothetical protein  46.34 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1437  hypothetical protein  48.48 
 
 		 158 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3988  protein of unknown function DUF1052  45.53 
 
 		 164 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4316  protein of unknown function DUF1052  45.53 
 
 		 164 aa  108  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0131225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0062  hypothetical protein  45.6 
 
 		 186 aa  105  2e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3412  hypothetical protein  42.48 
 
 		 165 aa  101  4e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0242  hypothetical protein  43.94 
 
 		 167 aa  95.9  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2989  hypothetical protein  39.44 
 
 		 159 aa  92  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0369405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2823  hypothetical protein  44.52 
 
 		 167 aa  83.6  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.0930467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>