38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpal_0573 on replicon NC_011004
Organism: Rhodopseudomonas palustris TIE-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011004  Rpal_0573  protein of unknown function DUF1052  100 
 
 		 152 aa  311  1.9999999999999998e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0132  hypothetical protein  91.45 
 
 		 159 aa  290  4e-78  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0717  hypothetical protein  89.47 
 
 		 159 aa  279  1e-74  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0375  hypothetical protein  82.78 
 
 		 160 aa  257  3e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7672  hypothetical protein  82 
 
 		 160 aa  257  4e-68  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0232  hypothetical protein  81.58 
 
 		 163 aa  255  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0112  hypothetical protein  78.15 
 
 		 163 aa  246  6e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0068  hypothetical protein  68.71 
 
 		 157 aa  206  1e-52  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0151  hypothetical protein  65.19 
 
 		 164 aa  183  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0062  hypothetical protein  65.69 
 
 		 186 aa  179  8.000000000000001e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4316  protein of unknown function DUF1052  61.48 
 
 		 164 aa  177  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0131225  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0138  hypothetical protein  63.7 
 
 		 164 aa  176  7e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0132  hypothetical protein  63.7 
 
 		 176 aa  176  7e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00369415  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2157  protein of unknown function DUF1052  62.42 
 
 		 161 aa  176  1e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3988  protein of unknown function DUF1052  59.26 
 
 		 164 aa  171  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4040  hypothetical protein  61.48 
 
 		 182 aa  169  2e-41  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612895  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3272  hypothetical protein  58.52 
 
 		 174 aa  166  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0307  hypothetical protein  58.87 
 
 		 152 aa  156  8e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645888  normal  0.0582971 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2789  protein of unknown function DUF1052  53.29 
 
 		 161 aa  155  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.542945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1144  hypothetical protein  53.64 
 
 		 170 aa  154  4e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.896319 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2894  protein of unknown function DUF1052  51.97 
 
 		 161 aa  152  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.696295  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2667  hypothetical protein  51.32 
 
 		 176 aa  150  4e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1054  protein of unknown function DUF1052  50 
 
 		 180 aa  150  7e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1437  hypothetical protein  50.67 
 
 		 158 aa  142  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4208  hypothetical protein  52.21 
 
 		 152 aa  135  1e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2903  hypothetical protein  50.76 
 
 		 165 aa  135  2e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0021  hypothetical protein  45.77 
 
 		 162 aa  129  1.0000000000000001e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0469027  normal  0.0489238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2122  hypothetical protein  45.86 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.653623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2244  hypothetical protein  48.48 
 
 		 146 aa  114  5e-25  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2407  hypothetical protein  46.67 
 
 		 155 aa  113  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0751  hypothetical protein  46.27 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0425  hypothetical protein  45.19 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.844666  normal  0.0652536 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3406  hypothetical protein  43.94 
 
 		 150 aa  109  1.0000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1550  hypothetical protein  40.14 
 
 		 158 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0501323 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2989  hypothetical protein  42.47 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0369405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0242  hypothetical protein  41.1 
 
 		 167 aa  95.1  3e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3412  hypothetical protein  40 
 
 		 165 aa  92.4  2e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2823  hypothetical protein  40.8 
 
 		 167 aa  81.6  0.000000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.0930467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>