39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2894 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2894  protein of unknown function DUF1052  100 
 
 		 161 aa  323  8.000000000000001e-88  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.696295  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2667  hypothetical protein  99.38 
 
 		 176 aa  321  2e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2789  protein of unknown function DUF1052  96.89 
 
 		 161 aa  318  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.542945 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1144  hypothetical protein  87.58 
 
 		 170 aa  279  1e-74  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.896319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1054  protein of unknown function DUF1052  70.37 
 
 		 180 aa  234  4e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1437  hypothetical protein  73.91 
 
 		 158 aa  221  2e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0068  hypothetical protein  55.56 
 
 		 157 aa  181  4.0000000000000006e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0307  hypothetical protein  58.78 
 
 		 152 aa  172  9.999999999999999e-43  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645888  normal  0.0582971 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4040  hypothetical protein  60.58 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612895  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2157  protein of unknown function DUF1052  55.7 
 
 		 161 aa  161  3e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0138  hypothetical protein  55.47 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0132  hypothetical protein  55.47 
 
 		 176 aa  159  1e-38  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00369415  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0062  hypothetical protein  56.3 
 
 		 186 aa  156  1e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3272  hypothetical protein  53.02 
 
 		 174 aa  156  1e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0717  hypothetical protein  50 
 
 		 159 aa  155  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0132  hypothetical protein  49.69 
 
 		 159 aa  155  3e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0021  hypothetical protein  53.19 
 
 		 162 aa  154  5.0000000000000005e-37  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0469027  normal  0.0489238 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3988  protein of unknown function DUF1052  54.81 
 
 		 164 aa  153  9e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0573  protein of unknown function DUF1052  51.97 
 
 		 152 aa  152  1e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4316  protein of unknown function DUF1052  54.07 
 
 		 164 aa  153  1e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0131225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0151  hypothetical protein  51.85 
 
 		 164 aa  152  1e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0112  hypothetical protein  52.26 
 
 		 163 aa  149  1e-35  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0232  hypothetical protein  50.31 
 
 		 163 aa  149  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0375  hypothetical protein  51.63 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7672  hypothetical protein  50 
 
 		 160 aa  147  7e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2903  hypothetical protein  54.69 
 
 		 165 aa  146  1.0000000000000001e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4208  hypothetical protein  54.1 
 
 		 152 aa  140  8e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2989  hypothetical protein  44.83 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0369405 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2122  hypothetical protein  45.99 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.653623  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0751  hypothetical protein  49.25 
 
 		 167 aa  120  8e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2407  hypothetical protein  48.89 
 
 		 155 aa  120  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0425  hypothetical protein  47.01 
 
 		 167 aa  116  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.844666  normal  0.0652536 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2823  hypothetical protein  49.65 
 
 		 167 aa  115  3e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3406  hypothetical protein  45.52 
 
 		 150 aa  114  6.9999999999999995e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1550  hypothetical protein  44.03 
 
 		 158 aa  112  3e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0501323 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2244  hypothetical protein  45.8 
 
 		 146 aa  104  6e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3412  hypothetical protein  40.65 
 
 		 165 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553828  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0242  hypothetical protein  42.42 
 
 		 167 aa  102  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1603  hypothetical protein  29.66 
 
 		 194 aa  40.8  0.008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.960077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>