38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_4208 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_4208  hypothetical protein  100 
 
 
152 aa  296  6e-80  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2903  hypothetical protein  63.93 
 
 
165 aa  160  5.0000000000000005e-39  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1054  protein of unknown function DUF1052  60.66 
 
 
180 aa  151  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1437  hypothetical protein  60.68 
 
 
158 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0307  hypothetical protein  55.71 
 
 
152 aa  146  1.0000000000000001e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645888  normal  0.0582971 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0062  hypothetical protein  48.57 
 
 
186 aa  143  8.000000000000001e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0021  hypothetical protein  53.23 
 
 
162 aa  143  8.000000000000001e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0469027  normal  0.0489238 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3272  hypothetical protein  50.81 
 
 
174 aa  142  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2667  hypothetical protein  54.1 
 
 
176 aa  140  6e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2894  protein of unknown function DUF1052  54.1 
 
 
161 aa  140  7e-33  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.696295  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2789  protein of unknown function DUF1052  54.92 
 
 
161 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.542945 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0132  hypothetical protein  50.38 
 
 
176 aa  139  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00369415  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4316  protein of unknown function DUF1052  48.55 
 
 
164 aa  138  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0131225  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR0138  hypothetical protein  50.38 
 
 
164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0068  hypothetical protein  47.89 
 
 
157 aa  139  1.9999999999999998e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.721927  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4040  hypothetical protein  53.6 
 
 
182 aa  138  3e-32  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612895  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0573  protein of unknown function DUF1052  52.21 
 
 
152 aa  135  1e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0232  hypothetical protein  51.91 
 
 
163 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3988  protein of unknown function DUF1052  47.83 
 
 
164 aa  134  4e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0132  hypothetical protein  52.21 
 
 
159 aa  134  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1144  hypothetical protein  52.46 
 
 
170 aa  134  6.0000000000000005e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.896319 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0151  hypothetical protein  48.09 
 
 
164 aa  132  9.999999999999999e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7672  hypothetical protein  48.2 
 
 
160 aa  130  5e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0375  hypothetical protein  50.38 
 
 
160 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0717  hypothetical protein  50.74 
 
 
159 aa  130  6e-30  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0112  hypothetical protein  48.48 
 
 
163 aa  124  5e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2157  protein of unknown function DUF1052  47.06 
 
 
161 aa  120  5e-27  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2407  hypothetical protein  46.51 
 
 
155 aa  117  7e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0425  hypothetical protein  46.51 
 
 
167 aa  116  9e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.844666  normal  0.0652536 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0751  hypothetical protein  45.74 
 
 
167 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2122  hypothetical protein  45.97 
 
 
155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.653623  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2989  hypothetical protein  45.99 
 
 
159 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0369405 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1550  hypothetical protein  45.16 
 
 
158 aa  108  2.0000000000000002e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0501323 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3406  hypothetical protein  41.6 
 
 
150 aa  102  1e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3412  hypothetical protein  41.04 
 
 
165 aa  103  1e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553828  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2244  hypothetical protein  43.59 
 
 
146 aa  100  6e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0242  hypothetical protein  43.08 
 
 
167 aa  92.4  2e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2823  hypothetical protein  45.45 
 
 
167 aa  88.6  3e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.0930467 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>