38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4316 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_4316  protein of unknown function DUF1052  100 
 
 
164 aa  342  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0131225  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3988  protein of unknown function DUF1052  96.95 
 
 
164 aa  334  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3272  hypothetical protein  79.22 
 
 
174 aa  260  4.999999999999999e-69  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0062  hypothetical protein  75.47 
 
 
186 aa  258  3e-68  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4040  hypothetical protein  65.16 
 
 
182 aa  219  1.9999999999999999e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612895  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0132  hypothetical protein  65.16 
 
 
176 aa  210  7e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00369415  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0138  hypothetical protein  65.16 
 
 
164 aa  210  7.999999999999999e-54  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0151  hypothetical protein  62.58 
 
 
164 aa  206  1e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0573  protein of unknown function DUF1052  61.48 
 
 
152 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0375  hypothetical protein  60.14 
 
 
160 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0717  hypothetical protein  60 
 
 
159 aa  174  6e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0132  hypothetical protein  60 
 
 
159 aa  173  9.999999999999999e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0068  hypothetical protein  58.52 
 
 
157 aa  171  3.9999999999999995e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.721927  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7672  hypothetical protein  55.15 
 
 
160 aa  167  6e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2157  protein of unknown function DUF1052  55.56 
 
 
161 aa  159  1e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0232  hypothetical protein  53.62 
 
 
163 aa  158  4e-38  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0307  hypothetical protein  54.74 
 
 
152 aa  154  7e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645888  normal  0.0582971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2894  protein of unknown function DUF1052  54.07 
 
 
161 aa  153  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.696295  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0112  hypothetical protein  54.07 
 
 
163 aa  153  1e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2789  protein of unknown function DUF1052  53.33 
 
 
161 aa  152  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.542945 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2667  hypothetical protein  54.07 
 
 
176 aa  152  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1144  hypothetical protein  52.59 
 
 
170 aa  151  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.896319 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1054  protein of unknown function DUF1052  49.66 
 
 
180 aa  147  5e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1437  hypothetical protein  51.56 
 
 
158 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2903  hypothetical protein  49.29 
 
 
165 aa  143  9e-34  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4208  hypothetical protein  48.55 
 
 
152 aa  138  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0021  hypothetical protein  45.99 
 
 
162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0469027  normal  0.0489238 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0751  hypothetical protein  40.67 
 
 
167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2407  hypothetical protein  40.67 
 
 
155 aa  111  5e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0425  hypothetical protein  45.53 
 
 
167 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.844666  normal  0.0652536 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1550  hypothetical protein  41.94 
 
 
158 aa  108  3e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.0501323 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2122  hypothetical protein  43.9 
 
 
155 aa  107  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.653623  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3406  hypothetical protein  40.16 
 
 
150 aa  94.7  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0242  hypothetical protein  39.42 
 
 
167 aa  93.6  1e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2989  hypothetical protein  36 
 
 
159 aa  91.7  4e-18  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0369405 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2823  hypothetical protein  40.91 
 
 
167 aa  86.7  1e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2244  hypothetical protein  36.52 
 
 
146 aa  84  9e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3412  hypothetical protein  34.31 
 
 
165 aa  80.1  0.00000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553828  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>