38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1144 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1144  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  339  1e-92  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.896319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2789  protein of unknown function DUF1052  88.89 
 
 		 161 aa  281  2.0000000000000002e-75  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.542945 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2894  protein of unknown function DUF1052  87.58 
 
 		 161 aa  279  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.696295  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2667  hypothetical protein  86.93 
 
 		 176 aa  277  5e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1054  protein of unknown function DUF1052  69.82 
 
 		 180 aa  238  4e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1437  hypothetical protein  75 
 
 		 158 aa  223  1e-57  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0068  hypothetical protein  57.93 
 
 		 157 aa  180  8.000000000000001e-45  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0307  hypothetical protein  58.78 
 
 		 152 aa  171  3.9999999999999995e-42  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645888  normal  0.0582971 
 
 
-
 
NC_004310  BR0138  hypothetical protein  59.42 
 
 		 164 aa  166  1e-40  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0132  hypothetical protein  59.42 
 
 		 176 aa  166  2e-40  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00369415  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4040  hypothetical protein  57.89 
 
 		 182 aa  163  1.0000000000000001e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612895  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2157  protein of unknown function DUF1052  54.78 
 
 		 161 aa  161  4.0000000000000004e-39  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0151  hypothetical protein  56.06 
 
 		 164 aa  159  1e-38  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0717  hypothetical protein  52.26 
 
 		 159 aa  157  6e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0132  hypothetical protein  51.61 
 
 		 159 aa  156  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0062  hypothetical protein  54.61 
 
 		 186 aa  155  2e-37  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0573  protein of unknown function DUF1052  53.64 
 
 		 152 aa  154  6e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0232  hypothetical protein  55.03 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0375  hypothetical protein  54.05 
 
 		 160 aa  152  2e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0112  hypothetical protein  54.05 
 
 		 163 aa  151  4e-36  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4316  protein of unknown function DUF1052  52.59 
 
 		 164 aa  151  4e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0131225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7672  hypothetical protein  52.74 
 
 		 160 aa  151  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3272  hypothetical protein  51.01 
 
 		 174 aa  150  7e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3988  protein of unknown function DUF1052  52.59 
 
 		 164 aa  148  3e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0021  hypothetical protein  51.06 
 
 		 162 aa  147  5e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0469027  normal  0.0489238 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2903  hypothetical protein  53.28 
 
 		 165 aa  137  6e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4208  hypothetical protein  52.46 
 
 		 152 aa  134  8e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2122  hypothetical protein  47.45 
 
 		 155 aa  123  1e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.653623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2407  hypothetical protein  47.83 
 
 		 155 aa  122  3e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2989  hypothetical protein  46.21 
 
 		 159 aa  120  9e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0369405 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0751  hypothetical protein  45.45 
 
 		 167 aa  119  9.999999999999999e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2823  hypothetical protein  49.06 
 
 		 167 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3406  hypothetical protein  47.76 
 
 		 150 aa  118  4.9999999999999996e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1550  hypothetical protein  44.6 
 
 		 158 aa  117  7e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0501323 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0425  hypothetical protein  47.41 
 
 		 167 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.844666  normal  0.0652536 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2244  hypothetical protein  48.48 
 
 		 146 aa  108  4.0000000000000004e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0242  hypothetical protein  41.06 
 
 		 167 aa  105  3e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3412  hypothetical protein  38.71 
 
 		 165 aa  96.3  2e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553828  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>