39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0375 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_0375  hypothetical protein  100 
 
 		 160 aa  325  1.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.84617 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0717  hypothetical protein  84.52 
 
 		 159 aa  273  9e-73  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0132  hypothetical protein  81.94 
 
 		 159 aa  267  5e-71  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0573  protein of unknown function DUF1052  82.78 
 
 		 152 aa  257  4e-68  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.808263  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0232  hypothetical protein  83.44 
 
 		 163 aa  256  6e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.855134  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7672  hypothetical protein  77.36 
 
 		 160 aa  254  2e-67  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0112  hypothetical protein  78.81 
 
 		 163 aa  247  5e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.10837 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0068  hypothetical protein  62.5 
 
 		 157 aa  186  1e-46  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.721927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4316  protein of unknown function DUF1052  60.14 
 
 		 164 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0131225  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0062  hypothetical protein  63.5 
 
 		 186 aa  172  9.999999999999999e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2157  protein of unknown function DUF1052  61.9 
 
 		 161 aa  173  9.999999999999999e-43  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3988  protein of unknown function DUF1052  57.97 
 
 		 164 aa  169  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0132  hypothetical protein  60.43 
 
 		 176 aa  167  4e-41  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00369415  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0138  hypothetical protein  60.87 
 
 		 164 aa  167  5e-41  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0151  hypothetical protein  58.7 
 
 		 164 aa  166  2e-40  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3272  hypothetical protein  56.52 
 
 		 174 aa  157  5e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4040  hypothetical protein  57.04 
 
 		 182 aa  154  4e-37  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.612895  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1144  hypothetical protein  54.05 
 
 		 170 aa  152  2e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.896319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2789  protein of unknown function DUF1052  53.59 
 
 		 161 aa  151  4e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.526175  normal  0.542945 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0307  hypothetical protein  55.63 
 
 		 152 aa  150  5.9999999999999996e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.645888  normal  0.0582971 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2894  protein of unknown function DUF1052  51.63 
 
 		 161 aa  148  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.696295  normal  0.077978 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1054  protein of unknown function DUF1052  51.95 
 
 		 180 aa  147  4e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.222529  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2667  hypothetical protein  50.98 
 
 		 176 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.616956 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1437  hypothetical protein  50.65 
 
 		 158 aa  137  4.999999999999999e-32  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2903  hypothetical protein  51.52 
 
 		 165 aa  134  4e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4208  hypothetical protein  50.38 
 
 		 152 aa  130  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0021  hypothetical protein  44.37 
 
 		 162 aa  124  4.0000000000000003e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0469027  normal  0.0489238 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2122  hypothetical protein  43.94 
 
 		 155 aa  121  3e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.653623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0425  hypothetical protein  46.67 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.844666  normal  0.0652536 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2407  hypothetical protein  46.27 
 
 		 155 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.745007 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0751  hypothetical protein  45.52 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2244  hypothetical protein  45.45 
 
 		 146 aa  106  1e-22  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1550  hypothetical protein  41.48 
 
 		 158 aa  104  6e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0501323 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3406  hypothetical protein  39.85 
 
 		 150 aa  101  5e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2989  hypothetical protein  41.78 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.0369405 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0242  hypothetical protein  42.03 
 
 		 167 aa  95.5  2e-19  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3412  hypothetical protein  37.25 
 
 		 165 aa  84  8e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.553828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2823  hypothetical protein  42.62 
 
 		 167 aa  77  0.0000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.198959  normal  0.0930467 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1603  hypothetical protein  24.03 
 
 		 194 aa  40.4  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.960077  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>