29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_0575 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_0575  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  301  2.0000000000000002e-81  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.251569  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6944  hypothetical protein  33.33 
 
 		 170 aa  77.8  0.00000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.73761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0915  hypothetical protein  35.14 
 
 		 168 aa  77  0.00000000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2748  hypothetical protein  33.78 
 
 		 182 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0210661 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4344  hypothetical protein  34.81 
 
 		 171 aa  76.3  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2577  hypothetical protein  33.79 
 
 		 175 aa  77  0.0000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0083  hypothetical protein  37.09 
 
 		 179 aa  75.9  0.0000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1210  hypothetical protein  33.79 
 
 		 175 aa  73.2  0.000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3546  hypothetical protein  32.65 
 
 		 173 aa  73.2  0.000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0727  hypothetical protein  40.85 
 
 		 146 aa  72.8  0.000000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3328  protein of unknown function DUF1465  33.79 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4328  hypothetical protein  34.69 
 
 		 176 aa  70.1  0.000000000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.726652 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1648  hypothetical protein  31.72 
 
 		 230 aa  69.7  0.00000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0792  hypothetical protein  33.12 
 
 		 170 aa  69.3  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2094  hypothetical protein  35.14 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169041  hitchhiker  0.000153662 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4492  hypothetical protein  32.28 
 
 		 171 aa  67.4  0.00000000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317459  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_004310  BR1705  hypothetical protein  31.03 
 
 		 168 aa  67.4  0.00000000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.742785  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2354  hypothetical protein  30.87 
 
 		 177 aa  63.9  0.0000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2633  protein of unknown function DUF1465  30.87 
 
 		 177 aa  63.9  0.0000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0762186 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1010  protein of unknown function DUF1465  34.09 
 
 		 179 aa  63.5  0.0000000009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3180  hypothetical protein  35.94 
 
 		 176 aa  60.5  0.000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2311  protein of unknown function DUF1465  29.53 
 
 		 177 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0987  protein of unknown function DUF1465  29.86 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3544  protein of unknown function DUF1465  35.06 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3247  protein of unknown function DUF1465  35.06 
 
 		 171 aa  56.6  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5370  hypothetical protein  29.91 
 
 		 176 aa  56.2  0.0000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471515  normal  0.0164904 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2660  hypothetical protein  30.09 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3663  hypothetical protein  30.65 
 
 		 171 aa  54.3  0.0000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3249  hypothetical protein  33.58 
 
 		 181 aa  53.1  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>