29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_1010 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_1010  protein of unknown function DUF1465  100 
 
 
179 aa  356  9.999999999999999e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366295 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3249  hypothetical protein  59.63 
 
 
181 aa  163  1.0000000000000001e-39  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3328  protein of unknown function DUF1465  56.55 
 
 
177 aa  162  3e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2311  protein of unknown function DUF1465  52.63 
 
 
177 aa  158  3e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2748  hypothetical protein  52.47 
 
 
182 aa  157  1e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0210661 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3546  hypothetical protein  51.2 
 
 
173 aa  156  1e-37  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6944  hypothetical protein  51.23 
 
 
170 aa  154  6e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.73761  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2633  protein of unknown function DUF1465  51.46 
 
 
177 aa  153  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0762186 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4344  hypothetical protein  51.25 
 
 
171 aa  151  5e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4328  hypothetical protein  53.22 
 
 
176 aa  151  5e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.726652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2354  hypothetical protein  50.88 
 
 
177 aa  151  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4492  hypothetical protein  50.62 
 
 
171 aa  149  1e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317459  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0987  protein of unknown function DUF1465  49.38 
 
 
169 aa  146  2.0000000000000003e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3544  protein of unknown function DUF1465  47.88 
 
 
171 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3247  protein of unknown function DUF1465  47.88 
 
 
171 aa  144  7.0000000000000006e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1210  hypothetical protein  45.98 
 
 
175 aa  143  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5370  hypothetical protein  47.93 
 
 
176 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471515  normal  0.0164904 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1648  hypothetical protein  46.58 
 
 
230 aa  140  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1705  hypothetical protein  46.58 
 
 
168 aa  139  1.9999999999999998e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.742785  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2660  hypothetical protein  48.5 
 
 
172 aa  138  3.9999999999999997e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3663  hypothetical protein  48.15 
 
 
171 aa  138  3.9999999999999997e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0792  hypothetical protein  46.34 
 
 
170 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3180  hypothetical protein  45.66 
 
 
176 aa  135  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2094  hypothetical protein  44.72 
 
 
196 aa  116  1.9999999999999998e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169041  hitchhiker  0.000153662 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0915  hypothetical protein  46.15 
 
 
168 aa  115  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2577  hypothetical protein  46.54 
 
 
175 aa  115  3e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0153  hypothetical protein  34.39 
 
 
172 aa  70.1  0.00000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0575  hypothetical protein  34.09 
 
 
154 aa  53.5  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.251569  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0083  hypothetical protein  29.55 
 
 
179 aa  41.6  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>