28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3247 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3544  protein of unknown function DUF1465  100 
 
 
171 aa  345  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3247  protein of unknown function DUF1465  100 
 
 
171 aa  345  1e-94  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3663  hypothetical protein  85.96 
 
 
171 aa  303  7e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2660  hypothetical protein  83.72 
 
 
172 aa  295  2e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1705  hypothetical protein  57.58 
 
 
168 aa  184  6e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.742785  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3180  hypothetical protein  59.04 
 
 
176 aa  184  6e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1648  hypothetical protein  57.58 
 
 
230 aa  183  8e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1210  hypothetical protein  55.95 
 
 
175 aa  179  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1010  protein of unknown function DUF1465  47.88 
 
 
179 aa  144  6e-34  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2748  hypothetical protein  51.19 
 
 
182 aa  143  1e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0210661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0987  protein of unknown function DUF1465  49.4 
 
 
169 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2311  protein of unknown function DUF1465  49.7 
 
 
177 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4492  hypothetical protein  48.59 
 
 
171 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317459  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2354  hypothetical protein  49.1 
 
 
177 aa  135  2e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2633  protein of unknown function DUF1465  49.1 
 
 
177 aa  135  2e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0762186 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3546  hypothetical protein  48.78 
 
 
173 aa  133  9.999999999999999e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6944  hypothetical protein  52.86 
 
 
170 aa  132  1.9999999999999998e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.73761  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3328  protein of unknown function DUF1465  49.4 
 
 
177 aa  131  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4344  hypothetical protein  48.47 
 
 
171 aa  130  9e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4328  hypothetical protein  46.06 
 
 
176 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.726652 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0792  hypothetical protein  48.55 
 
 
170 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5370  hypothetical protein  47.8 
 
 
176 aa  120  9e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471515  normal  0.0164904 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0915  hypothetical protein  46.75 
 
 
168 aa  119  9.999999999999999e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2094  hypothetical protein  47.45 
 
 
196 aa  114  5e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169041  hitchhiker  0.000153662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3249  hypothetical protein  45.34 
 
 
181 aa  111  4.0000000000000004e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2577  hypothetical protein  45.81 
 
 
175 aa  111  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0153  hypothetical protein  41.56 
 
 
172 aa  103  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0575  hypothetical protein  39.39 
 
 
154 aa  55.8  0.0000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.251569  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>