29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2660 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009636  Smed_2660  hypothetical protein  100 
 
 		 172 aa  352  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3663  hypothetical protein  86.63 
 
 		 171 aa  305  1.0000000000000001e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3544  protein of unknown function DUF1465  83.72 
 
 		 171 aa  295  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3247  protein of unknown function DUF1465  83.72 
 
 		 171 aa  295  2e-79  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_004310  BR1705  hypothetical protein  57.93 
 
 		 168 aa  181  4.0000000000000006e-45  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.742785  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3180  hypothetical protein  57.49 
 
 		 176 aa  181  6e-45  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1648  hypothetical protein  57.32 
 
 		 230 aa  179  1e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1210  hypothetical protein  57.23 
 
 		 175 aa  179  2e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1010  protein of unknown function DUF1465  48.5 
 
 		 179 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366295 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2748  hypothetical protein  49.11 
 
 		 182 aa  137  7.999999999999999e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0210661 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0987  protein of unknown function DUF1465  49.09 
 
 		 169 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6944  hypothetical protein  52.98 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.73761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2311  protein of unknown function DUF1465  47.62 
 
 		 177 aa  132  3e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4492  hypothetical protein  47.31 
 
 		 171 aa  130  1.0000000000000001e-29  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317459  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3546  hypothetical protein  52.86 
 
 		 173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0792  hypothetical protein  52.17 
 
 		 170 aa  129  3e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4344  hypothetical protein  48.15 
 
 		 171 aa  128  5.0000000000000004e-29  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2354  hypothetical protein  46.43 
 
 		 177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2633  protein of unknown function DUF1465  46.43 
 
 		 177 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0762186 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3328  protein of unknown function DUF1465  48.19 
 
 		 177 aa  127  6e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4328  hypothetical protein  46.39 
 
 		 176 aa  125  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.726652 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2094  hypothetical protein  50.36 
 
 		 196 aa  123  1e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169041  hitchhiker  0.000153662 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5370  hypothetical protein  45.34 
 
 		 176 aa  119  3e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471515  normal  0.0164904 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3249  hypothetical protein  45.34 
 
 		 181 aa  116  9.999999999999999e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0915  hypothetical protein  44.87 
 
 		 168 aa  116  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2577  hypothetical protein  44.23 
 
 		 175 aa  111  5e-24  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0153  hypothetical protein  40.38 
 
 		 172 aa  105  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0575  hypothetical protein  39.39 
 
 		 154 aa  54.3  0.0000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.251569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0083  hypothetical protein  29.75 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>