20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0083 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0083  hypothetical protein  100 
 
 		 179 aa  362  1e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0575  hypothetical protein  37.09 
 
 		 154 aa  75.1  0.0000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.251569  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0727  hypothetical protein  36.96 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0987  protein of unknown function DUF1465  30.89 
 
 		 169 aa  52  0.000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4344  hypothetical protein  36.71 
 
 		 171 aa  50.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3546  hypothetical protein  31.21 
 
 		 173 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0915  hypothetical protein  34.55 
 
 		 168 aa  50.1  0.00002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4492  hypothetical protein  32.98 
 
 		 171 aa  49.7  0.00003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317459  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0792  hypothetical protein  31.82 
 
 		 170 aa  49.3  0.00003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2094  hypothetical protein  38.46 
 
 		 196 aa  48.5  0.00006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169041  hitchhiker  0.000153662 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2748  hypothetical protein  32.77 
 
 		 182 aa  47.8  0.00009  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0210661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3328  protein of unknown function DUF1465  37.8 
 
 		 177 aa  45.8  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6944  hypothetical protein  32.5 
 
 		 170 aa  43.9  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.73761  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2354  hypothetical protein  35.29 
 
 		 177 aa  43.1  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1210  hypothetical protein  27.21 
 
 		 175 aa  42.4  0.004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4328  hypothetical protein  33.94 
 
 		 176 aa  41.2  0.007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.726652 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1010  protein of unknown function DUF1465  29.55 
 
 		 179 aa  41.6  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2633  protein of unknown function DUF1465  34.12 
 
 		 177 aa  41.6  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0762186 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3180  hypothetical protein  28.89 
 
 		 176 aa  41.6  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2660  hypothetical protein  29.75 
 
 		 172 aa  41.2  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>