29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BBta_6944 on replicon NC_009485
Organism: Bradyrhizobium sp. BTAi1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009485  BBta_6944  hypothetical protein  100 
 
 		 170 aa  343  6e-94  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.73761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0792  hypothetical protein  78.24 
 
 		 170 aa  275  2e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0987  protein of unknown function DUF1465  79.88 
 
 		 169 aa  268  4e-71  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4492  hypothetical protein  78.36 
 
 		 171 aa  267  5e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317459  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4344  hypothetical protein  78.36 
 
 		 171 aa  264  5e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3546  hypothetical protein  76.47 
 
 		 173 aa  261  4.999999999999999e-69  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2748  hypothetical protein  75.29 
 
 		 182 aa  255  2e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0210661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2311  protein of unknown function DUF1465  51.83 
 
 		 177 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2633  protein of unknown function DUF1465  50.61 
 
 		 177 aa  154  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0762186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4328  hypothetical protein  52.2 
 
 		 176 aa  155  4e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.726652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2354  hypothetical protein  50.61 
 
 		 177 aa  154  4e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1010  protein of unknown function DUF1465  51.23 
 
 		 179 aa  154  5.0000000000000005e-37  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366295 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3328  protein of unknown function DUF1465  52.5 
 
 		 177 aa  151  4e-36  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5370  hypothetical protein  49.69 
 
 		 176 aa  147  6e-35  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471515  normal  0.0164904 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1210  hypothetical protein  45.96 
 
 		 175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1648  hypothetical protein  46.58 
 
 		 230 aa  138  3e-32  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1705  hypothetical protein  46.58 
 
 		 168 aa  138  3.9999999999999997e-32  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.742785  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3663  hypothetical protein  49.7 
 
 		 171 aa  137  8.999999999999999e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2660  hypothetical protein  52.98 
 
 		 172 aa  133  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3247  protein of unknown function DUF1465  52.86 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3544  protein of unknown function DUF1465  52.86 
 
 		 171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3180  hypothetical protein  45.09 
 
 		 176 aa  131  3e-30  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0915  hypothetical protein  49.67 
 
 		 168 aa  131  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2577  hypothetical protein  48.67 
 
 		 175 aa  126  2.0000000000000002e-28  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2094  hypothetical protein  49.35 
 
 		 196 aa  124  6e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169041  hitchhiker  0.000153662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3249  hypothetical protein  50.93 
 
 		 181 aa  118  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0153  hypothetical protein  39.19 
 
 		 172 aa  95.9  3e-19  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0575  hypothetical protein  33.76 
 
 		 154 aa  76.3  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.251569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0083  hypothetical protein  32.5 
 
 		 179 aa  43.9  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>