29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4492 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4492  hypothetical protein  100 
 
 		 171 aa  340  4e-93  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317459  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4344  hypothetical protein  92.98 
 
 		 171 aa  322  2e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0987  protein of unknown function DUF1465  88.24 
 
 		 169 aa  298  2e-80  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6944  hypothetical protein  78.36 
 
 		 170 aa  267  5e-71  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.73761  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0792  hypothetical protein  76.02 
 
 		 170 aa  256  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3546  hypothetical protein  73.1 
 
 		 173 aa  249  2e-65  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2748  hypothetical protein  74.27 
 
 		 182 aa  248  4e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0210661 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2311  protein of unknown function DUF1465  52.76 
 
 		 177 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1010  protein of unknown function DUF1465  50.62 
 
 		 179 aa  149  1e-35  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366295 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2633  protein of unknown function DUF1465  50.92 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0762186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4328  hypothetical protein  52.44 
 
 		 176 aa  149  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.726652 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2354  hypothetical protein  50.92 
 
 		 177 aa  149  2e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1648  hypothetical protein  48.26 
 
 		 230 aa  147  7e-35  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3328  protein of unknown function DUF1465  51.83 
 
 		 177 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1210  hypothetical protein  46.82 
 
 		 175 aa  143  1e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3180  hypothetical protein  48.86 
 
 		 176 aa  143  1e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1705  hypothetical protein  48.77 
 
 		 168 aa  142  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.742785  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5370  hypothetical protein  50 
 
 		 176 aa  142  3e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471515  normal  0.0164904 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3663  hypothetical protein  50.3 
 
 		 171 aa  138  3e-32  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3247  protein of unknown function DUF1465  48.59 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3544  protein of unknown function DUF1465  48.59 
 
 		 171 aa  135  2e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2660  hypothetical protein  47.31 
 
 		 172 aa  130  1.0000000000000001e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0915  hypothetical protein  46.47 
 
 		 168 aa  129  2.0000000000000002e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2577  hypothetical protein  50.66 
 
 		 175 aa  129  3e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2094  hypothetical protein  47.95 
 
 		 196 aa  122  2e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169041  hitchhiker  0.000153662 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3249  hypothetical protein  47.31 
 
 		 181 aa  113  1.0000000000000001e-24  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0153  hypothetical protein  39.51 
 
 		 172 aa  101  6e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0575  hypothetical protein  31.65 
 
 		 154 aa  66.6  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.251569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0083  hypothetical protein  32.98 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>