30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_4328 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010511  M446_4328  hypothetical protein  100 
 
 
176 aa  351  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.726652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3328  protein of unknown function DUF1465  88.07 
 
 
177 aa  316  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2311  protein of unknown function DUF1465  70.29 
 
 
177 aa  233  9e-61  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5370  hypothetical protein  67.8 
 
 
176 aa  228  4e-59  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.471515  normal  0.0164904 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2354  hypothetical protein  68 
 
 
177 aa  226  1e-58  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2633  protein of unknown function DUF1465  67.43 
 
 
177 aa  224  4e-58  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0762186 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0792  hypothetical protein  52.83 
 
 
170 aa  158  5e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2748  hypothetical protein  54.09 
 
 
182 aa  156  2e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0210661 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6944  hypothetical protein  52.2 
 
 
170 aa  155  4e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.73761  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3546  hypothetical protein  52.2 
 
 
173 aa  152  2e-36  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1010  protein of unknown function DUF1465  53.22 
 
 
179 aa  151  5e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00366295 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4344  hypothetical protein  53.09 
 
 
171 aa  150  8e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0987  protein of unknown function DUF1465  52.15 
 
 
169 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4492  hypothetical protein  52.44 
 
 
171 aa  149  2e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.317459  normal  0.736755 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0915  hypothetical protein  54.72 
 
 
168 aa  143  1e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1648  hypothetical protein  46.47 
 
 
230 aa  135  2e-31  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.168418  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1210  hypothetical protein  44.24 
 
 
175 aa  134  6.0000000000000005e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1705  hypothetical protein  45.88 
 
 
168 aa  134  9.999999999999999e-31  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.742785  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3663  hypothetical protein  47.27 
 
 
171 aa  132  1.9999999999999998e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2577  hypothetical protein  47.1 
 
 
175 aa  130  9e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2094  hypothetical protein  48.39 
 
 
196 aa  126  1.0000000000000001e-28  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169041  hitchhiker  0.000153662 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3180  hypothetical protein  46.02 
 
 
176 aa  127  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2660  hypothetical protein  46.39 
 
 
172 aa  125  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3247  protein of unknown function DUF1465  46.06 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3544  protein of unknown function DUF1465  46.06 
 
 
171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3249  hypothetical protein  49.1 
 
 
181 aa  117  9e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0153  hypothetical protein  36.67 
 
 
172 aa  81.3  0.000000000000007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0575  hypothetical protein  34.01 
 
 
154 aa  68.2  0.00000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.251569  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0727  hypothetical protein  32.11 
 
 
146 aa  44.3  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0083  hypothetical protein  33.94 
 
 
179 aa  41.2  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>