16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_0727 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_0727  hypothetical protein  100 
 
 		 146 aa  288  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0575  hypothetical protein  40.14 
 
 		 154 aa  80.1  0.00000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.251569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0083  hypothetical protein  35.66 
 
 		 179 aa  68.9  0.00000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2094  hypothetical protein  32.5 
 
 		 196 aa  49.7  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.169041  hitchhiker  0.000153662 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4328  hypothetical protein  31.06 
 
 		 176 aa  47  0.00008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.726652 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3328  protein of unknown function DUF1465  34.09 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2633  protein of unknown function DUF1465  31.13 
 
 		 177 aa  44.3  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0762186 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2354  hypothetical protein  31.13 
 
 		 177 aa  43.9  0.0008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0609598 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0915  hypothetical protein  33.33 
 
 		 168 aa  42.7  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.587358  normal  0.0252217 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2311  protein of unknown function DUF1465  30.72 
 
 		 177 aa  42.4  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.104043 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3663  hypothetical protein  30.15 
 
 		 171 aa  42  0.002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2577  hypothetical protein  33.8 
 
 		 175 aa  41.6  0.004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2660  hypothetical protein  35.62 
 
 		 172 aa  41.2  0.005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3247  protein of unknown function DUF1465  34.25 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.21889 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3544  protein of unknown function DUF1465  34.25 
 
 		 171 aa  40.8  0.006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0987  protein of unknown function DUF1465  29.1 
 
 		 169 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>