19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_01030 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_01030  hypothetical protein  100 
 
 		 284 aa  568  1e-161  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.331625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0089  hypothetical protein  72.66 
 
 		 266 aa  388  1e-107  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1685  hypothetical protein  40.78 
 
 		 285 aa  157  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6469  hypothetical protein  34.77 
 
 		 273 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.138089 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1869  hypothetical protein  36.9 
 
 		 282 aa  126  5e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3788  hypothetical protein  34.45 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1108  hypothetical protein  33.69 
 
 		 293 aa  120  1.9999999999999998e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.21675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07010  hypothetical protein  31.47 
 
 		 292 aa  119  4.9999999999999996e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.31198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4257  hypothetical protein  35.19 
 
 		 287 aa  112  8.000000000000001e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0517934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8846  hypothetical protein  31.64 
 
 		 256 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4687  hypothetical protein  34.15 
 
 		 287 aa  107  2e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.61029 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0656  hypothetical protein  32.76 
 
 		 299 aa  103  5e-21  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18900  hypothetical protein  30.32 
 
 		 289 aa  102  8e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.030031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0707  hypothetical protein  35.62 
 
 		 291 aa  94  2e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328568  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1917  hypothetical protein  32.61 
 
 		 276 aa  94  3e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0266356  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2261  hypothetical protein  27.87 
 
 		 339 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.093768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2006  hypothetical protein  27.33 
 
 		 292 aa  75.5  0.0000000000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4888  hypothetical protein  28.16 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10640  hypothetical protein  27.93 
 
 		 308 aa  62.4  0.000000008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.096707  normal  0.752785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>