19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1869 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1869  hypothetical protein  100 
 
 
282 aa  537  9.999999999999999e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1108  hypothetical protein  52.52 
 
 
293 aa  210  2e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.21675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07010  hypothetical protein  46.18 
 
 
292 aa  200  1.9999999999999998e-50  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.31198 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0656  hypothetical protein  41.98 
 
 
299 aa  171  9e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1917  hypothetical protein  48.2 
 
 
276 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0266356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1685  hypothetical protein  40.59 
 
 
285 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0089  hypothetical protein  40 
 
 
266 aa  146  4.0000000000000006e-34  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18900  hypothetical protein  39.35 
 
 
289 aa  143  4e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.030031  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6469  hypothetical protein  38.85 
 
 
273 aa  135  5e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.138089 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01030  hypothetical protein  36.9 
 
 
284 aa  134  1.9999999999999998e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.331625  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3788  hypothetical protein  35.84 
 
 
312 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4687  hypothetical protein  38.49 
 
 
287 aa  120  3e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4257  hypothetical protein  38.06 
 
 
287 aa  118  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0517934 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8846  hypothetical protein  36.92 
 
 
256 aa  115  8.999999999999998e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4888  hypothetical protein  28.86 
 
 
298 aa  114  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10640  hypothetical protein  39.52 
 
 
308 aa  112  9e-24  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.096707  normal  0.752785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2006  hypothetical protein  34.78 
 
 
292 aa  109  4.0000000000000004e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2261  hypothetical protein  29.59 
 
 
339 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.093768  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0707  hypothetical protein  33.33 
 
 
291 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>