19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8846 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_8846  hypothetical protein  100 
 
 
256 aa  498  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3788  hypothetical protein  42.91 
 
 
312 aa  150  2e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0089  hypothetical protein  35.42 
 
 
266 aa  132  5e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1685  hypothetical protein  37.98 
 
 
285 aa  126  4.0000000000000003e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2261  hypothetical protein  33.1 
 
 
339 aa  125  1e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.093768  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1869  hypothetical protein  36.56 
 
 
282 aa  112  7.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01030  hypothetical protein  31.64 
 
 
284 aa  110  3e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.331625  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0656  hypothetical protein  35.92 
 
 
299 aa  108  8.000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1917  hypothetical protein  37.27 
 
 
276 aa  106  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0266356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0707  hypothetical protein  34.59 
 
 
291 aa  106  5e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328568  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6469  hypothetical protein  34.08 
 
 
273 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.138089 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18900  hypothetical protein  34.32 
 
 
289 aa  103  4e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.030031  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07010  hypothetical protein  33.09 
 
 
292 aa  100  3e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.31198 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4257  hypothetical protein  33.22 
 
 
287 aa  95.1  1e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0517934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1108  hypothetical protein  31.34 
 
 
293 aa  93.6  3e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.21675 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2006  hypothetical protein  30.11 
 
 
292 aa  92.4  6e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4687  hypothetical protein  32.56 
 
 
287 aa  88.6  9e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61029 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4888  hypothetical protein  28.21 
 
 
298 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10640  hypothetical protein  34.35 
 
 
308 aa  60.8  0.00000002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.096707  normal  0.752785 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>