19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0656 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_0656  hypothetical protein  100 
 
 
299 aa  580  1e-164  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07010  hypothetical protein  41.26 
 
 
292 aa  167  1e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.31198 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1108  hypothetical protein  44.88 
 
 
293 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.21675 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1869  hypothetical protein  41.55 
 
 
282 aa  162  9e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18900  hypothetical protein  39.08 
 
 
289 aa  144  1e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.030031  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1917  hypothetical protein  41.64 
 
 
276 aa  130  4.0000000000000003e-29  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0266356  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3788  hypothetical protein  37.16 
 
 
312 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6469  hypothetical protein  37.5 
 
 
273 aa  126  5e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.138089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1685  hypothetical protein  38.28 
 
 
285 aa  125  6e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4687  hypothetical protein  39.93 
 
 
287 aa  121  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4257  hypothetical protein  37.2 
 
 
287 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0517934 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0089  hypothetical protein  35.31 
 
 
266 aa  113  5e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8846  hypothetical protein  35.92 
 
 
256 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10640  hypothetical protein  35.14 
 
 
308 aa  104  1e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.096707  normal  0.752785 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01030  hypothetical protein  32.76 
 
 
284 aa  103  5e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.331625  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2006  hypothetical protein  30.45 
 
 
292 aa  90.1  4e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4888  hypothetical protein  25.68 
 
 
298 aa  87  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0707  hypothetical protein  30.69 
 
 
291 aa  74.7  0.000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328568  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2261  hypothetical protein  26.53 
 
 
339 aa  64.3  0.000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.093768  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>