18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tfu_2261 on replicon NC_007333
Organism: Thermobifida fusca YX



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2261  hypothetical protein  100 
 
 
339 aa  675    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.093768  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8846  hypothetical protein  33.1 
 
 
256 aa  130  5.0000000000000004e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1685  hypothetical protein  34.04 
 
 
285 aa  119  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6469  hypothetical protein  32.76 
 
 
273 aa  118  9.999999999999999e-26  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.138089 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3788  hypothetical protein  33.44 
 
 
312 aa  112  7.000000000000001e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0089  hypothetical protein  30.63 
 
 
266 aa  105  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4257  hypothetical protein  33.55 
 
 
287 aa  97.4  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0517934 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1108  hypothetical protein  30.53 
 
 
293 aa  96.3  6e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.21675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01030  hypothetical protein  28.76 
 
 
284 aa  95.5  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.331625  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4687  hypothetical protein  33.67 
 
 
287 aa  95.9  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07010  hypothetical protein  27.96 
 
 
292 aa  93.6  4e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.31198 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1917  hypothetical protein  31.03 
 
 
276 aa  80.9  0.00000000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0266356  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0707  hypothetical protein  31.15 
 
 
291 aa  75.9  0.0000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328568  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4888  hypothetical protein  25.67 
 
 
298 aa  74.3  0.000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10640  hypothetical protein  27.48 
 
 
308 aa  72  0.00000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.096707  normal  0.752785 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2006  hypothetical protein  25.64 
 
 
292 aa  72.4  0.00000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18900  hypothetical protein  27.05 
 
 
289 aa  72  0.00000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.030031  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0656  hypothetical protein  26.48 
 
 
299 aa  71.2  0.00000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>