19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4257 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_4257  hypothetical protein  100 
 
 		 287 aa  561  1.0000000000000001e-159  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.0517934 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4687  hypothetical protein  82.87 
 
 		 287 aa  427  1e-118  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.61029 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6469  hypothetical protein  52.71 
 
 		 273 aa  248  1e-64  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.138089 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1108  hypothetical protein  40.14 
 
 		 293 aa  150  2e-35  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.21675 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1685  hypothetical protein  39.93 
 
 		 285 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18900  hypothetical protein  37.24 
 
 		 289 aa  149  4e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.030031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07010  hypothetical protein  37.29 
 
 		 292 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.31198 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1917  hypothetical protein  38.41 
 
 		 276 aa  133  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0266356  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0656  hypothetical protein  37.2 
 
 		 299 aa  124  2e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3788  hypothetical protein  35.69 
 
 		 312 aa  121  9.999999999999999e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01030  hypothetical protein  35.19 
 
 		 284 aa  120  3e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.331625  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0089  hypothetical protein  34.72 
 
 		 266 aa  117  1.9999999999999998e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1869  hypothetical protein  36.39 
 
 		 282 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0707  hypothetical protein  33.56 
 
 		 291 aa  103  4e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328568  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8846  hypothetical protein  33.22 
 
 		 256 aa  102  8e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10640  hypothetical protein  33.56 
 
 		 308 aa  96.3  5e-19  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.096707  normal  0.752785 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2261  hypothetical protein  33 
 
 		 339 aa  91.3  2e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.093768  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2006  hypothetical protein  27.21 
 
 		 292 aa  86.7  4e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4888  hypothetical protein  26.37 
 
 		 298 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>