19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4687 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_4687  hypothetical protein  100 
 
 
287 aa  551  1e-156  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4257  hypothetical protein  82.87 
 
 
287 aa  434  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0517934 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6469  hypothetical protein  50.72 
 
 
273 aa  239  5e-62  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.138089 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1685  hypothetical protein  43.54 
 
 
285 aa  163  3e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1108  hypothetical protein  44.06 
 
 
293 aa  161  1e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.21675 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07010  hypothetical protein  41.24 
 
 
292 aa  161  1e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.31198 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18900  hypothetical protein  40.35 
 
 
289 aa  154  2e-36  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.030031  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1917  hypothetical protein  42.6 
 
 
276 aa  146  3e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0266356  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0656  hypothetical protein  39.93 
 
 
299 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3788  hypothetical protein  37.29 
 
 
312 aa  130  2.0000000000000002e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0707  hypothetical protein  36.61 
 
 
291 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328568  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1869  hypothetical protein  37.04 
 
 
282 aa  124  2e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01030  hypothetical protein  34.49 
 
 
284 aa  118  9.999999999999999e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.331625  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10640  hypothetical protein  36.77 
 
 
308 aa  117  3e-25  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.096707  normal  0.752785 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0089  hypothetical protein  34.16 
 
 
266 aa  115  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2006  hypothetical protein  31.91 
 
 
292 aa  99.8  4e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8846  hypothetical protein  34.81 
 
 
256 aa  99.8  5e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2261  hypothetical protein  33.77 
 
 
339 aa  98.2  1e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.093768  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4888  hypothetical protein  29.33 
 
 
298 aa  84  0.000000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>