19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Haur_4888 on replicon NC_009972
Organism: Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_4888  hypothetical protein  100 
 
 
298 aa  609  1e-173  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2006  hypothetical protein  40.86 
 
 
292 aa  196  4.0000000000000005e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1869  hypothetical protein  28.19 
 
 
282 aa  113  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.326361  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1917  hypothetical protein  29.69 
 
 
276 aa  99.4  7e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0266356  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1685  hypothetical protein  30.04 
 
 
285 aa  98.2  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3788  hypothetical protein  30.77 
 
 
312 aa  97.8  2e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07010  hypothetical protein  28.57 
 
 
292 aa  95.1  1e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.31198 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1108  hypothetical protein  27.8 
 
 
293 aa  95.5  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.21675 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6469  hypothetical protein  29.33 
 
 
273 aa  90.1  4e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.138089 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0089  hypothetical protein  31.1 
 
 
266 aa  89  8e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0656  hypothetical protein  25.68 
 
 
299 aa  87  3e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8846  hypothetical protein  28.21 
 
 
256 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10640  hypothetical protein  28.48 
 
 
308 aa  79  0.00000000000009  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.096707  normal  0.752785 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_18900  hypothetical protein  26.57 
 
 
289 aa  74.3  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.030031  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4687  hypothetical protein  27.76 
 
 
287 aa  73.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.61029 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01030  hypothetical protein  28.16 
 
 
284 aa  72.8  0.000000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.331625  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2261  hypothetical protein  26 
 
 
339 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.093768  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4257  hypothetical protein  25.16 
 
 
287 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0517934 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0707  hypothetical protein  26.14 
 
 
291 aa  63.2  0.000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.328568  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>