More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1647 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1647  dihydropteroate synthase  100 
 
 
380 aa  769    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.000944705  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1374  dihydropteroate synthase  53.68 
 
 
380 aa  417  9.999999999999999e-116  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000647265  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0672  dihydropteroate synthase  44.47 
 
 
380 aa  333  2e-90  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.999539  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1084  dihydropteroate synthase  45.73 
 
 
380 aa  328  9e-89  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.982793  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0613  dihydropteroate synthase  44.9 
 
 
380 aa  323  4e-87  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0688  dihydropteroate synthase  44.9 
 
 
380 aa  320  3e-86  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.201794  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1567  dihydropteroate synthase  43.68 
 
 
380 aa  306  5.0000000000000004e-82  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2021  putative dihydropteroate synthase  43.54 
 
 
379 aa  305  1.0000000000000001e-81  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000920733  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1002  dihydropteroate synthase  38.14 
 
 
406 aa  294  2e-78  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1113  dihydropteroate synthase  43.7 
 
 
380 aa  291  9e-78  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0029811  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0939  dihydropteroate synthase  37.11 
 
 
397 aa  259  5.0000000000000005e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2253  dihydropteroate synthase  38.99 
 
 
400 aa  247  3e-64  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.379586  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0616  dihydropteroate synthase  36.08 
 
 
400 aa  222  9.999999999999999e-57  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2523  dihydropteroate synthase  36.77 
 
 
413 aa  219  5e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.974941  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0098  dihydropteroate synthase  40.51 
 
 
275 aa  219  6e-56  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0619  dihydropteroate synthase  37.01 
 
 
397 aa  217  2e-55  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000204624  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0095  dihydropteroate synthase  34.02 
 
 
396 aa  216  5e-55  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0868  dihydropteroate synthase  44.06 
 
 
266 aa  216  7e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1883  dihydropteroate synthase  33.86 
 
 
394 aa  212  1e-53  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.436317  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4718  dihydropteroate synthase  41.83 
 
 
283 aa  209  7e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0235  dihydropteroate synthase  35.62 
 
 
394 aa  208  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.683276 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0784  dihydropteroate synthase  43.35 
 
 
279 aa  208  1e-52  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.362908  unclonable  0.000000150876 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4717  dihydropteroate synthase  41.44 
 
 
283 aa  207  4e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00896074 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0110  dihydropteroate synthase  32.58 
 
 
402 aa  206  4e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4583  dihydropteroate synthase  41.83 
 
 
283 aa  206  5e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.918855  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3451  dihydropteroate synthase  43.41 
 
 
286 aa  206  6e-52  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3614  dihydropteroate synthase  41.67 
 
 
283 aa  205  1e-51  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13508  putative dihydropteroate synthase  38.66 
 
 
283 aa  205  1e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3354  dihydropteroate synthase  40.38 
 
 
276 aa  204  1e-51  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.2621  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2719  dihydropteroate synthase  41.27 
 
 
278 aa  204  2e-51  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0514311  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0715  dihydropteroate synthase  41.44 
 
 
283 aa  203  3e-51  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.964503  normal  0.0739685 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0310  dihydropteroate synthase  41.83 
 
 
272 aa  203  4e-51  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3567  dihydropteroate synthase  43.14 
 
 
279 aa  202  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00503342  hitchhiker  0.00000448434 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0905  dihydropteroate synthase  40.77 
 
 
278 aa  200  3e-50  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0884892  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0593  dihydropteroate synthase  41.09 
 
 
277 aa  200  3.9999999999999996e-50  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.271496  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2581  dihydropteroate synthase  33.33 
 
 
393 aa  199  6e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0151  dihydropteroate synthase  31.65 
 
 
407 aa  198  1.0000000000000001e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.355211  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0210  dihydropteroate synthase  42.21 
 
 
376 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0984  dihydropteroate synthase  42.35 
 
 
287 aa  197  3e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000265095  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2710  dihydropteroate synthase  40.93 
 
 
264 aa  196  4.0000000000000005e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2841  dihydropteroate synthase  40.93 
 
 
264 aa  196  6e-49  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0396  dihydropteroate synthase  39.77 
 
 
302 aa  196  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.327356  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0167  dihydropteroate synthase  41.57 
 
 
278 aa  196  8.000000000000001e-49  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000848147  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0883  dihydropteroate synthase  40 
 
 
278 aa  196  8.000000000000001e-49  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0252047  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4186  dihydropteroate synthase  40.15 
 
 
283 aa  195  1e-48  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.572392 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0955  dihydropteroate synthase  39.62 
 
 
279 aa  195  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0212772  normal  0.281578 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03042  7,8-dihydropteroate synthase  41.98 
 
 
282 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000457475  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0530  dihydropteroate synthase  41.98 
 
 
282 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0023005  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4499  dihydropteroate synthase  41.98 
 
 
282 aa  194  2e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00232473  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0154  dihydropteroate synthase  34.46 
 
 
399 aa  194  2e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.465574  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2108  dihydropteroate synthase  39.84 
 
 
272 aa  194  2e-48  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02993  hypothetical protein  41.98 
 
 
282 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000407498  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0523  dihydropteroate synthase  41.98 
 
 
282 aa  194  2e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00018335  hitchhiker  0.00147266 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3593  dihydropteroate synthase  41.98 
 
 
282 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346067  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3473  dihydropteroate synthase  41.98 
 
 
282 aa  194  2e-48  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000584102  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1020  dihydropteroate synthase  40.7 
 
 
277 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000388358  hitchhiker  0.000398045 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1085  dihydropteroate synthase  40.7 
 
 
277 aa  194  2e-48  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00216639  normal  0.0692827 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3369  dihydropteroate synthase  41.98 
 
 
282 aa  194  2e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000338476  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3662  dihydropteroate synthase  41.98 
 
 
282 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000648754  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3223  dihydropteroate synthase  39.18 
 
 
286 aa  193  3e-48  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62850  dihydropteroate synthase  39.02 
 
 
283 aa  193  3e-48  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1021  dihydropteroate synthase  40.14 
 
 
277 aa  194  3e-48  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00384832  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0773  dihydropteroate synthase  39.02 
 
 
283 aa  193  4e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00166691  normal  0.0199876 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2816  dihydropteroate synthase  41.85 
 
 
275 aa  193  4e-48  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2410  dihydropteroate synthase  43.46 
 
 
276 aa  193  4e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.146452  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3611  dihydropteroate synthase  40.91 
 
 
282 aa  193  5e-48  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00230251  normal  0.142126 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5470  dihydropteroate synthase  39.39 
 
 
283 aa  193  5e-48  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.592135  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0812  dihydropteroate synthase  38.66 
 
 
277 aa  193  5e-48  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.346679  hitchhiker  0.00737464 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3066  dihydropteroate synthase  40.31 
 
 
280 aa  192  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000940885  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0633  dihydropteroate synthase  40.32 
 
 
258 aa  192  7e-48  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4496  dihydropteroate synthase  39.16 
 
 
283 aa  192  8e-48  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1572  dihydropteroate synthase  39.62 
 
 
274 aa  192  1e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0119126  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3351  dihydropteroate synthase  40.84 
 
 
277 aa  191  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.0017412  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1198  dihydropteroate synthase  40.7 
 
 
277 aa  191  2e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2840  dihydropteroate synthase  39.92 
 
 
277 aa  191  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000230549  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0484  dihydropteroate synthase  39.31 
 
 
277 aa  191  2e-47  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00193978  normal  0.18931 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0550  dihydropteroate synthase  39.22 
 
 
286 aa  191  2e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.860771 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1024  dihydropteroate synthase  40.7 
 
 
277 aa  191  2e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0113899  hitchhiker  0.0000441656 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2833  dihydropteroate synthase  38.17 
 
 
282 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0289164  normal  0.0133795 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3653  dihydropteroate synthase  41.15 
 
 
282 aa  190  4e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0472359  normal  0.97325 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3591  dihydropteroate synthase  41.15 
 
 
282 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0668157  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3484  dihydropteroate synthase  41.15 
 
 
282 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0132953  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3554  dihydropteroate synthase  41.15 
 
 
282 aa  189  5e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.775184  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0675  dihydropteroate synthase  32.7 
 
 
347 aa  189  5e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2233  dihydropteroate synthase  38.99 
 
 
292 aa  189  5.999999999999999e-47  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1469  dihydropteroate synthase  37.22 
 
 
298 aa  189  8e-47  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.400128  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0813  dihydropteroate synthase  40.61 
 
 
275 aa  189  8e-47  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00164146  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3485  dihydropteroate synthase  41.15 
 
 
282 aa  188  1e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.137354  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1674  dihydropteroate synthase  41.29 
 
 
271 aa  188  1e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.055413 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3470  dihydropteroate synthase  39.54 
 
 
277 aa  188  1e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.194075  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1001  dihydropteroate synthase  39.13 
 
 
282 aa  188  1e-46  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0129268  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2306  dihydropteroate synthase  38.26 
 
 
331 aa  188  1e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.369686  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3395  dihydropteroate synthase  39.53 
 
 
280 aa  187  2e-46  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000218907  hitchhiker  0.0003141 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0097  dihydropteroate synthase  32.48 
 
 
412 aa  188  2e-46  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2635  dihydropteroate synthase  41 
 
 
277 aa  187  3e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3080  dihydropteroate synthase  39.85 
 
 
290 aa  187  3e-46  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.642553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3735  dihydropteroate synthase  37.79 
 
 
277 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00714217  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3601  dihydropteroate synthase  37.79 
 
 
277 aa  187  4e-46  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000106991  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2261  dihydropteroate synthase  40.77 
 
 
258 aa  186  6e-46  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00525567  hitchhiker  0.00000000957493 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1925  dihydropteroate synthase  38.93 
 
 
291 aa  186  6e-46  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  decreased coverage  0.00000353988  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>