169 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2440 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2440  siderophore-interacting protein  100 
 
 
236 aa  478  1e-134  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194052  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2595  siderophore-interacting protein  89.79 
 
 
236 aa  438  9.999999999999999e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0509214  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0652  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  47.03 
 
 
250 aa  217  1e-55  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177683  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2227  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  48.5 
 
 
238 aa  204  7e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3965  siderophore-interacting protein  45.49 
 
 
238 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4039  siderophore-interacting protein  45.49 
 
 
238 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3979  siderophore-interacting protein  45.49 
 
 
238 aa  196  3e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0619387  normal  0.0405263 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4468  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  45.06 
 
 
238 aa  194  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0529  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  43.44 
 
 
240 aa  177  2e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  32.38 
 
 
859 aa  122  6e-27  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3678  siderophore-interacting protein  32.21 
 
 
345 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  28.92 
 
 
304 aa  76.6  0.0000000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  31.77 
 
 
247 aa  75.9  0.0000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  32.49 
 
 
274 aa  75.1  0.0000000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  33.51 
 
 
284 aa  75.1  0.000000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3413  siderophore-interacting protein  31.55 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185243  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  37.85 
 
 
283 aa  72.4  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  37.5 
 
 
277 aa  72.4  0.000000000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  30.26 
 
 
251 aa  70.5  0.00000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  29.46 
 
 
253 aa  70.9  0.00000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  32.64 
 
 
297 aa  70.1  0.00000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  27.08 
 
 
274 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  30.26 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0833  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  35.91 
 
 
267 aa  69.3  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  29.82 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  29.82 
 
 
250 aa  68.6  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  36.42 
 
 
267 aa  68.6  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2101  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.06 
 
 
296 aa  68.2  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.41911  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  28.63 
 
 
253 aa  67  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0912  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  31.79 
 
 
274 aa  67.4  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5976  iron transport/utilisation related protein  36.52 
 
 
280 aa  67  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.129591 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  33.88 
 
 
259 aa  67  0.0000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  35.23 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  29.88 
 
 
253 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  28.75 
 
 
252 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  33.51 
 
 
266 aa  65.9  0.0000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  29.71 
 
 
291 aa  65.1  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.89 
 
 
247 aa  64.7  0.000000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  29.38 
 
 
255 aa  63.9  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  32.58 
 
 
270 aa  63.9  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  33.15 
 
 
279 aa  63.9  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  27.59 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0091  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  27.83 
 
 
250 aa  63.5  0.000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  27.71 
 
 
248 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3477  Siderophore-interacting protein  31.46 
 
 
289 aa  63.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.200803  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  30.68 
 
 
255 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0363  Siderophore-interacting protein  26.86 
 
 
265 aa  63.2  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  32.95 
 
 
348 aa  62.8  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2220  Siderophore-interacting protein  29.24 
 
 
298 aa  61.2  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683509  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4106  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  29.27 
 
 
280 aa  61.6  0.00000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.375544  normal  0.287442 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2442  Siderophore-interacting protein  27.62 
 
 
267 aa  61.6  0.00000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.402244  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  32.09 
 
 
623 aa  60.8  0.00000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.7 
 
 
279 aa  60.8  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1452  Siderophore-interacting protein  33.52 
 
 
275 aa  60.1  0.00000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.100932  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  25.63 
 
 
272 aa  60.1  0.00000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  30.74 
 
 
258 aa  60.5  0.00000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  30.43 
 
 
281 aa  59.7  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  29.9 
 
 
366 aa  59.7  0.00000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3380  siderophore-interacting protein  28.95 
 
 
272 aa  58.5  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384925  normal  0.192847 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0911  siderophore-interacting protein  29.28 
 
 
234 aa  58.5  0.00000009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0168967  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  27.31 
 
 
261 aa  58.2  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3561  Siderophore-interacting protein  37.08 
 
 
283 aa  57.8  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.740373 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1918  siderophore-interacting protein  26.46 
 
 
257 aa  58.2  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149107  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2266  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.71 
 
 
267 aa  57.8  0.0000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3789  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  27.06 
 
 
322 aa  57.8  0.0000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03709  hypothetical protein  28.5 
 
 
277 aa  57  0.0000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3787  Siderophore-interacting protein  31.25 
 
 
290 aa  57  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000271751 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2259  FAD-binding 9, siderophore-interacting  26.11 
 
 
254 aa  57  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0871  siderophore-interacting protein  29.08 
 
 
247 aa  56.6  0.0000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.314795  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3252  hypothetical protein  26.99 
 
 
302 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0678384  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  28.57 
 
 
340 aa  57  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2724  Siderophore-interacting protein  29.05 
 
 
311 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3532  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.68 
 
 
257 aa  56.2  0.0000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2932  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  26.88 
 
 
275 aa  56.2  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453632  hitchhiker  0.000505579 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2573  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.8 
 
 
267 aa  55.5  0.0000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  24.46 
 
 
257 aa  55.5  0.0000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  30.06 
 
 
278 aa  55.5  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6722  Siderophore-interacting protein  24.5 
 
 
349 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.550685  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  32.1 
 
 
275 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  32.1 
 
 
275 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4373  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  28.73 
 
 
277 aa  54.3  0.000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0726253  normal  0.734809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0811  FAD-binding 9, siderophore-interacting  27.27 
 
 
225 aa  55.1  0.000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.330061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38220  hypothetical protein  26.99 
 
 
302 aa  54.7  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00068918 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  32.1 
 
 
275 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  32.1 
 
 
275 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  32.1 
 
 
275 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  32.1 
 
 
275 aa  54.3  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  32.1 
 
 
275 aa  54.3  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4137  siderophore-interacting protein  26.89 
 
 
281 aa  55.1  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  31.03 
 
 
273 aa  55.1  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  25.79 
 
 
281 aa  54.7  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1601  Siderophore-interacting protein  33.15 
 
 
265 aa  54.7  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0535  Siderophore-interacting protein  29.9 
 
 
617 aa  54.3  0.000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.911825  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_26520  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophore transport system, ATPase component  29.65 
 
 
625 aa  53.9  0.000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  30.21 
 
 
272 aa  54.3  0.000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2205  siderophore-interacting protein  27.27 
 
 
281 aa  53.9  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.2309  normal  0.357405 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4275  siderophore-interacting protein  33.7 
 
 
295 aa  53.9  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.716792  normal  0.162196 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0628  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  24.55 
 
 
299 aa  54.3  0.000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2998  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  25.58 
 
 
298 aa  53.9  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0124793  normal  0.0292007 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0112  Siderophore-interacting protein  32.97 
 
 
277 aa  53.9  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>