160 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_0652 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_0652  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  100 
 
 
250 aa  508  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.177683  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4468  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  56.54 
 
 
238 aa  240  1e-62  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2227  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  55.27 
 
 
238 aa  235  6e-61  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3965  siderophore-interacting protein  52.54 
 
 
238 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4039  siderophore-interacting protein  52.54 
 
 
238 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3979  siderophore-interacting protein  52.54 
 
 
238 aa  230  2e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0619387  normal  0.0405263 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2595  siderophore-interacting protein  46.61 
 
 
236 aa  219  5e-56  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0509214  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2440  siderophore-interacting protein  47.03 
 
 
236 aa  207  2e-52  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.194052  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0529  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  45.38 
 
 
240 aa  204  9e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.421217  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11378  drug ABC transporter ATP-binding protein  32 
 
 
859 aa  139  4.999999999999999e-32  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3586  Siderophore-interacting protein  29.76 
 
 
279 aa  90.5  3e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  31.98 
 
 
253 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.155373 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0387  Siderophore-interacting protein  27.73 
 
 
247 aa  78.2  0.0000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1056  iron-chelator utilization protein, putative  32.56 
 
 
253 aa  76.6  0.0000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4272  siderophore-interacting protein  28.44 
 
 
281 aa  76.3  0.0000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4199  FAD-binding 9, siderophore-interacting protein  27.81 
 
 
270 aa  76.3  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4573  siderophore-interacting protein  29.07 
 
 
261 aa  75.1  0.000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2184  siderophore-interacting protein  27.63 
 
 
246 aa  75.1  0.000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.249595  normal  0.170908 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4356  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.4 
 
 
253 aa  73.2  0.000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.386359 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0094  siderophore-interacting protein  28.07 
 
 
250 aa  72.8  0.000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3678  siderophore-interacting protein  29.19 
 
 
345 aa  72  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0096  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.63 
 
 
247 aa  72  0.000000000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4255  siderophore-interacting protein  27.51 
 
 
250 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0099  siderophore-interacting protein  27.63 
 
 
252 aa  70.1  0.00000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06780  siderophore-interacting protein  24.57 
 
 
284 aa  69.7  0.00000000004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.942698 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3413  siderophore-interacting protein  29.19 
 
 
345 aa  69.7  0.00000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.185243  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4193  iron utilization protein, putative  28.49 
 
 
255 aa  69.3  0.00000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0091  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  25.64 
 
 
250 aa  69.3  0.00000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0127  siderophore-interacting protein  28.33 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.636914  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1086  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  31.03 
 
 
252 aa  69.3  0.00000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1323  Siderophore-interacting protein  25.82 
 
 
297 aa  69.3  0.00000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1592  Siderophore-interacting protein  29.26 
 
 
259 aa  69.3  0.00000000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.0952253 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0097  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  25.64 
 
 
248 aa  68.6  0.00000000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1856  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.35 
 
 
283 aa  68.2  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0769877  normal  0.504316 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0096  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  25.64 
 
 
248 aa  67.8  0.0000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3043  siderophore-interacting protein  29.28 
 
 
623 aa  67.4  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0076  siderophore-interacting protein  27.19 
 
 
251 aa  66.6  0.0000000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0888  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  26.98 
 
 
279 aa  67  0.0000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0336  siderophore-interacting protein  26.99 
 
 
361 aa  66.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.152303  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3427  siderophore-interacting protein  27.03 
 
 
277 aa  66.6  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0328876  normal  0.310709 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25640  siderophore-interacting protein  27.89 
 
 
274 aa  66.2  0.0000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.819064  normal  0.256648 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3927  siderophore-interacting protein  28.49 
 
 
255 aa  65.5  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.179382 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5308  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  26.83 
 
 
270 aa  65.9  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4066  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.27 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.515055 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2693  Siderophore-interacting protein  28.87 
 
 
272 aa  65.5  0.0000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.285306  normal  0.0865031 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3953  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.27 
 
 
275 aa  65.5  0.0000000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.568339  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2810  FAD-binding 9, siderophore-interacting  32.68 
 
 
348 aa  65.5  0.0000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.445177  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1452  Siderophore-interacting protein  29.28 
 
 
275 aa  64.7  0.000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.100932  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5549  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  27.52 
 
 
308 aa  63.9  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.438451  normal  0.147517 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06920  hypothetical protein  22.92 
 
 
272 aa  63.9  0.000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3395  vibriobactin utilization protein ViuB  24.53 
 
 
295 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.472238 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1091  putative iron transport/utilisation related protein  25.7 
 
 
275 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0143564 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0589  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  24.39 
 
 
300 aa  63.5  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0924  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  25.17 
 
 
294 aa  63.5  0.000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.455037  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5630  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  26.91 
 
 
283 aa  63.2  0.000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_37330  siderophore-interacting protein  25.91 
 
 
291 aa  62.4  0.000000006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03709  hypothetical protein  26.51 
 
 
277 aa  61.6  0.00000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5142  FAD-binding 9, siderophore-interacting  26.59 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.145805  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5717  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  26.59 
 
 
273 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.263002 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4522  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  26.59 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.45393  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0918  Siderophore-interacting protein  24.79 
 
 
273 aa  61.6  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0021  siderophore-interacting protein  27.72 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1528  siderophore-interacting protein  27.72 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1173  siderophore-interacting protein  27.72 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1453  siderophore-interacting protein  27.72 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0029  siderophore-interacting protein  27.72 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.000742042  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0027  siderophore-interacting protein  27.72 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0026  siderophore-interacting protein  27.72 
 
 
275 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2448  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  26.18 
 
 
256 aa  60.5  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4986  FAD-binding 9, siderophore-interacting domain-containing protein  26.98 
 
 
273 aa  60.1  0.00000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4296  Siderophore-interacting protein  25.76 
 
 
340 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000530029 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1901  siderophore-interacting protein  25.39 
 
 
366 aa  60.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2401  Siderophore-interacting protein  25.88 
 
 
276 aa  59.3  0.00000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000149826  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2998  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  24.26 
 
 
298 aa  59.3  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0124793  normal  0.0292007 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3163  siderophore-interacting protein  26.59 
 
 
273 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3129  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  27.78 
 
 
273 aa  58.9  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1601  Siderophore-interacting protein  28 
 
 
265 aa  58.9  0.00000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.168298 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0833  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  25.22 
 
 
267 aa  58.5  0.00000009  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0634  FAD-binding 9, siderophore-interacting  21.34 
 
 
274 aa  58.5  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000911  utilization protein for catechol-siderophore  22.54 
 
 
257 aa  57.8  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0628  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  22.38 
 
 
299 aa  57.8  0.0000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2021  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  23.78 
 
 
281 aa  58.2  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.523412 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4275  siderophore-interacting protein  27.47 
 
 
295 aa  57.8  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.716792  normal  0.162196 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3804  siderophore-interacting protein  24.81 
 
 
277 aa  57.4  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.48919  normal  0.177514 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4183  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  28.96 
 
 
301 aa  57.8  0.0000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2366  Siderophore-interacting protein  28.51 
 
 
258 aa  57  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.277442  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1126  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  23.9 
 
 
271 aa  56.6  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.708544  normal  0.382701 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0811  FAD-binding 9, siderophore-interacting  24.77 
 
 
225 aa  56.6  0.0000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.330061  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2762  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain-containing protein  25.81 
 
 
299 aa  56.6  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00250469 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0424  Siderophore-interacting protein  23.53 
 
 
321 aa  56.2  0.0000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.625757 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1918  siderophore-interacting protein  25.57 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.149107  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2220  Siderophore-interacting protein  24.6 
 
 
298 aa  56.2  0.0000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0683509  normal  0.779648 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3532  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  25 
 
 
257 aa  56.2  0.0000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.400944  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13510  siderophore-interacting protein  23.36 
 
 
267 aa  55.1  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5107  iron utilization protein  23.97 
 
 
278 aa  55.5  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.711747  normal  0.0617503 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2173  FAD-binding 9 siderophore-interacting domain protein  26.09 
 
 
256 aa  55.1  0.0000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0791652  normal  0.527206 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3695  Siderophore-interacting protein  28.57 
 
 
298 aa  55.1  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03816  putative siderophore utilization protein  24.47 
 
 
257 aa  55.1  0.000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0023  siderophore-interacting protein  24.19 
 
 
275 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.403062  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2699  siderophore-interacting protein  24.87 
 
 
304 aa  54.3  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.295882  normal  0.656005 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>