23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_3804 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_0656  hypothetical protein  56.94 
 
 		 574 aa  666    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3804  hypothetical protein  100 
 
 		 582 aa  1189    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.978239 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0779  hypothetical protein  65.52 
 
 		 576 aa  784    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0748977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3076  hypothetical protein  53.97 
 
 		 578 aa  630  1e-179  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.647061  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3060  hypothetical protein  52.76 
 
 		 578 aa  628  1e-179  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.139923  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0859  hypothetical protein  53.62 
 
 		 578 aa  627  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3733  hypothetical protein  53.28 
 
 		 578 aa  622  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0896  hypothetical protein  53.97 
 
 		 578 aa  622  1e-177  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0950  hypothetical protein  52.07 
 
 		 578 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3412  hypothetical protein  52.07 
 
 		 578 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0924  hypothetical protein  52.07 
 
 		 578 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0958  hypothetical protein  51.9 
 
 		 578 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0668  hypothetical protein  49.83 
 
 		 571 aa  593  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  unclonable  0.00000473139 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3190  hypothetical protein  46.19 
 
 		 574 aa  567  1e-160  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0937  hypothetical protein  43.67 
 
 		 572 aa  538  9.999999999999999e-153  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.00000000154044  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2792  hypothetical protein  45.61 
 
 		 575 aa  525  1e-148  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2895  hypothetical protein  44.68 
 
 		 569 aa  509  1e-143  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.127239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001077  hypothetical protein  33.33 
 
 		 584 aa  330  4e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00935089  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04809  hypothetical protein  34.44 
 
 		 597 aa  316  9e-85  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3607  pilus retraction protein PilT  29.23 
 
 		 700 aa  211  2e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.13786  decreased coverage  0.000230198 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0857  hypothetical protein  28.52 
 
 		 699 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.866373 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2391  hypothetical protein  23.78 
 
 		 562 aa  94.7  4e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.71929  normal  0.65601 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0837  hypothetical protein  21.59 
 
 		 568 aa  76.3  0.000000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>